ハイパープレップキット (for illumina)
KAPA HyperPrep Kit (for illumina)
微量DNAサンプルからのライブラリー調製に最適な、ライブラリー調製キット
特長
- 微量DNAサンプルからのライブラリー調製に最適 “1 ng~”
- サンプル調製時間の短縮 “Total 2~3時間” (従来:約5時間)
- 新組成バッファーによるライゲーション効率の更なる向上により、インプットサンプル"100 ng~"の"PCRフリーライブラリー調整"が可能に
- 全ゲノムシークエンス、ターゲットシークエンス、ChiP Seqなどの微量インプットサンプルに対応
- ハイフィデリティーエンジニア酵素(KAPA HiFi)による増幅バイアスの低減でシークエンスカバー率を向上
- アジレント・テクノロジー社 SureSelect XTターゲットエンリッチメントシステムとの組み合わせにより、WES(全エクソン解析)も可能
※ DNAの断片化は別途コバリスなどの断片化装置で行ってください。
ライブラリーの収量増大とシークエンス・クオリティーの向上
- ライゲーション効率の向上による高いライブラリー収量
- エンジニア酵素(KAPA HiFi)による低いDuplication Rateと高いカバレッジを実現
ライブラリー作製を3時間以内に
- エンドリペアとA-テーリングの酵素反応を一元化し、SPRI精製なしでアダプターライゲーション反応へ
- One-TubeワークフローによりSPRI精製ステップを最小限に減らし、PCRフリーなら2時間以内、PCR増幅を必要とする場合でも3時間以内のハンズオン・タイムを実現
- 最小限の操作ステップにより、ライブラリー作製の一貫性と再現性を向上
SeqCap EZ HyperCap
SeqCap EZターゲットエンリッチメント・システム(ハイブリダイゼーションキャプチャー技術に基づいたシステム)のライブラリー調製ステップにおいてKAPA HyperPrep (または HyperPlus Kit) を採用する事による、ワークフロー全体の劇的な時間短縮を実現した効率的なプロトコル
本ワークフローは、アプリケーションに特化した効率的かつ合理的、そして自動化にも最適なアプローチです。
SureSelect XT (アジレント・テクノロジー社)との組み合わせによる使用
組み合わせに必要な試薬については、下記のアジレント・テクノロジー社 製品ページをご覧ください。
文献情報
1. Library Construction from Subnanogram DNA for Pelagic Sea Water and Deep-Sea Sediments
(遠洋海水および深海堆積物中のサブナノグラムDNAからのライブラリー構築)
Miho Hirai1, Shinro Nishi1,2, Miwako Tsuda2, Michinari Sunamura2,3, Yoshihiro Takaki1,2,4*, and Takuro Nunoura1,2
Microbes Environ. Vol. 32, No. 4, 336-343, 2017
2.De Novo Assembly of the Transcriptome of Turritopsis, a Jellyfish That Repeatedly Rejuvenates
ZOOLOGICAL SCIENCE 33: 366–371 (2016)
3. Whole-exome sequencing of cell-free DNA and circulating tumor cells in multiple myeloma
(多発性骨髄腫におけるセルフリーDNA(cfDNA)および末梢血循環腫瘍細胞(CTC)の全エクソノーム配列決定)
Manier, J. Park, M. Capelletti, M. Bustoros, S. S. Freeman, G. Ha, J. Rhoades, C. J. Liu, D. Huynh, S. C. Reed, G. Gydush, K. Z. Salem, D. Rotem, C. Freymond, A. Yosef, A. Perilla-Glen, L. Garderet, E. M. Van Allen, S. Kumar, J. C. Love, G. Getz, V. A. Adalsteinsson & I. M. Ghobrial
Nature Communicationsvolume 9, Article number: 1691 (2018)
関連動画
Cancer Research Challenge / がん研究におけるターゲットエンリッチメント・シークエンスとそのライブラリー調製(AACR 2017にて)
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