KAPA NGS FFPE DNA Polishing Kit

KAPA NGS FFPE DNA Polishing Kit

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KAPA HyperPETE Somatic Tissue DNA Workflowで使用する、FFPE抽出DNAより脱アミノ化されたシトシンを除去するために用いるキット

KAPA HyperPETE Somatic Tissue DNA Workflowで使用する、FFPE抽出DNAより脱アミノ化されたシトシンを除去するために用いるキット

特長

FFPE検体として保存されていたサンプルのDNAは、脱アミノ化により、シトシン(C)からウラシル(U)への塩基置換が起こる場合があります。この置換により生じたUは、PCRに伴いT 変換されるため、C>T(もしくはG>A)シーケンスエラーの原因となり、バリアントコールする際のノイズになります。KAPA NGS FFPE DNA Polishing Kitは、このウラシルを有するDNAを酵素を用いて除去、分解するキットです。これにより、FFPE検体でみられる脱アミノ化シトシン由来のアーティファクトを軽減します。

 

KAPA HyperPETE Somatic Tissue DNA Workflow

 

DNA polishingは、DNA抽出/精製(FFPET DNA isolation)工程で得られたDNAを、精製DNAの品質評価(Q-score derived FFPET hgDNA工程)した後に実施します。DNA polishing後には、精製を必要とすることなく、ライブラリー調製のDNA断片化行程に使用することができます。

関連製品

仕様

製品 構成内容 入数 内容量

24反応(09217215001)

NGS DNA Polishing Enzyme 1 16 µL

96反応(09217223001)

NGS DNA Polishing Enzyme 4 16 µL
  • 保存温度:-15℃~-25℃
  • 使用期限は、ラベル記載に準ずる

※注意事項※
NGS DNA Polishing Enzymeは、室温(~25℃)以上の温度に長時間さらさないでください。

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