KAPA NGS FFPE DNA Polishing Kit
KAPA NGS FFPE DNA Polishing Kit
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KAPA HyperPETE Somatic Tissue DNA Workflowで使用する、FFPE抽出DNAより脱アミノ化されたシトシンを除去するために用いるキット
KAPA HyperPETE Somatic Tissue DNA Workflowで使用する、FFPE抽出DNAより脱アミノ化されたシトシンを除去するために用いるキット
特長
FFPE検体として保存されていたサンプルのDNAは、脱アミノ化により、シトシン(C)からウラシル(U)への塩基置換が起こる場合があります。この置換により生じたUは、PCRに伴いT 変換されるため、C>T(もしくはG>A)シーケンスエラーの原因となり、バリアントコールする際のノイズになります。KAPA NGS FFPE DNA Polishing Kitは、このウラシルを有するDNAを酵素を用いて除去、分解するキットです。これにより、FFPE検体でみられる脱アミノ化シトシン由来のアーティファクトを軽減します。
KAPA HyperPETE Somatic Tissue DNA Workflow
DNA polishingは、DNA抽出/精製(FFPET DNA isolation)工程で得られたDNAを、精製DNAの品質評価(Q-score derived FFPET hgDNA工程)した後に実施します。DNA polishing後には、精製を必要とすることなく、ライブラリー調製のDNA断片化行程に使用することができます。
関連製品
- KAPA FFPE DNA Extraction Kit
- KAPA FFPE DNA QC Kit
- KAPA HyperPure Beads
- KAPA HyperPlus Kit
- KAPA HyperPrep Kit
- KAPA UDI Primer Mixes, 1-96
- KAPA Universal Adapter
- KAPA Universal UMI Adapter
仕様
製品 | 構成内容 | 入数 | 内容量 |
---|---|---|---|
24反応(09217215001) |
NGS DNA Polishing Enzyme | 1 | 16 µL |
96反応(09217223001) |
NGS DNA Polishing Enzyme | 4 | 16 µL |
- 保存温度:-15℃~-25℃
- 使用期限は、ラベル記載に準ずる
※注意事項※
NGS DNA Polishing Enzymeは、室温(~25℃)以上の温度に長時間さらさないでください。