ユニバーサルアダプター & ユニークデュアルインデックス(UDI)プライマーミックス

KAPA Universal Adapter & UDI Primer Mixes

よくあるご質問3件

イルミナプラットフォームでのシーケンスを目的としたライゲーションベースのアダプター。KAPA ユニークデュアルインデックス(UDI)プライマーミックスと共に使用し、DNAサンプルからユニークにラベル付けされたライブラリーを作製する事が可能

特長

KAPA ユニバーサルアダプター

  • Illuminaプラットフォーム上の次世代シーケンシング(NGS)用の短いアダプター
  • A-tailingステップの後、T-overhangsを付加し、ライブラリーフラグメントにライゲーションする。
  • サンプルバーコードは、ターゲットエンリッチメントに先立って、ライブラリー増幅ステップで組み込まれる。

 

KAPA ユニークデュアルインデックス(UDI)プライマーミックス

  • 最大384種類のインデックスに対応
  • KAPA UDI Primer Mixは、フォワードプライマーとリバースプライマーを事前に混合した組み合わせ
    プライマーには、イルミナシーケンサーのインデックスミスアライメント(「インデックスホッピング」)を軽減する ように設計された個別の8ヌクレオチドインデックスが含まれる。
  • KAPA ユニバーサルアダプターと組み合わせて使用し、次世代シーケンシング(NGS)用に個々のDNAサンプルから一意にインデックスが付加されたライブラリーを生成
  • 固有のインデックスを付加する事により、ターゲットキャプチャまたはクラスター生成の前にライブラリーをプールして、マルチプレックスシーケンスに適したライブラリー作製が可能
    (また、KAPA Hyper Kit シリーズにも使用する事が可能)

KAPAアダプター選択ガイド

機能

 

KAPA ユニーク デュアルインデックス アダプター

KAPA HyperPlex アダプター

ユニバーサルアダプター

(本製品)

ユニバーサルUMIアダプター

インデックス数 96 384
P5 + P7バーコードの数 96 + 96 384 + 384
lllumina社と同じインデックス配列 いいえ(1) いいえ(1)
全てのIllumina社シーケンサーに対応
(patterned / non-patterned flow cells)
対応 対応
PCRフリーのライブラリー調製 対応 ⾮対応
分子バーコード なし なし あり

対応しているライブラリー調製キット

KAPA HyperPrepKAPA HyperPlus
KAPA RNA HyperPrep
KAPA HyperCap

 

メーカー検証済み

メーカー検証済み

互換性あり(2)

 

互換性あり

メーカー検証済み

メーカー検証済み

 

互換性あり

互換性あり

メーカー検証済み

KAPA Universal Enhancing Oligosとの互換性 あり あり
アダプターの情報

Full length、15 µM、

4反応/アダプター(3)

Truncated、15 µM、

1反応/アダプター(3)

Truncated、33 µM、

1反応/アダプター(3)

キット構成 ハードシェル96ウェルプレートで提供(4) アダプターは、チューブで提供
プライマーミックスはハードシェル96ウェルプレートで提供(4)
KAPA Adapter Dilution Buffer 付属(1キットあたり25 mL) 別売

(1) KAPA ユニーク デュアルインデックス アダプター(KAPA UDI アダプター)およびKAPA UDIプライマーミックスに使⽤されている192および768のバーコード配列のセットは、Roche社の独占的なものであり、P5/P7それぞれのセット間で異なっています。

(2) 理論的には可能ですが、十分に検証されていません。

(3) アダプターの希釈が不要な場合、KAPA HyperPrep KitまたはKAPA HyperPlus Kitを使用して、それぞれ4回または1回のライブラリー調製を行うのに十分な量が提供されます。

(4) KAPA UDIプライマーミックスとKAPA UDI アダプターのプレートは、剥離可能なシール付きで出荷されます。交換⽤アルミシールは、プレート1枚につき3枚提供されます。


* KAPA HyperPlex アダプターおよびKAPA UDI アダプターはMethyl-seqアプリケーションとの互換性はありません。


※本製品(KAPA Universal Adapter & UDI Primer Mixes)とKAPA HyperPlus Kitの組み合わせでライブラリー調製する手順については、ドキュメントタブ内の製品評価試験データの後半でご紹介しています。

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