エルフ

特長

• パルスフィールド電気泳動方式により、長鎖DNAサンプルにも対応
• 1サンプルから12フラクションに連続分画可能
• 2つのゲル濃度で100 bp～18 kbで対応可能
• 1回のRunで2カセット同時抽出が可能
• 再現性の高い自動抽出が可能
• 貴重なDNAサンプルを無駄なく分画利用でき、効率よく研究に利用することができます。
• カンタン操作＆ハンズオンタイムはわずか20～30分
• RNA-Seqでのデータ解析（アセンブル）の複雑さを軽減
  cDNAサンプルをSageELFでサイズ別にフラクション分離して、それぞれのフラクション毎に異なるbarcode index付きライブラリーを作製
  このライブラリーをNGS解析する際に、barcode index毎にフラクションのサイズ情報を利用することで、解析上で発生し易いキメラ・コンティグを軽減させることが可能
• メーカー保証期間：１年間

アプリケーション

• High Fidelity Long Read Sequencing
• ペアエンドシーケンス
• メイトペアシーケンシング
• RNA-seq＊
  ＊ライブラリー（DNA）の分画抽出となります。RNAの分画抽出には対応しておりません。

プレキャストアガロースゲルカセット

DNA分画用のゲルカセットは、分画サイズ100 bp～18 kbまで対応できるよう、濃度別に2種類ご用意しております。
アプリケーションによっては、正確性と再現性を確保する為インターナルスタンダードを使用したものもお選び頂けます。

 

ゲルカセットの種類とターゲットサイズ

• 2% agarose, 100 bp – 2.3 kb （2～3 hr/Run）
• 0.75% agarose, 1 kb – 18 kb （3～5 hr/Run）
  最大泳動量 5 µg断片化DNA/lane
  最小泳動量 100 ng断片化DNA/lane

海外での使用実績

英国The Genome Analysis CentreにおけるSageELFのLong Mate-Pairへの活用
（Sage Scienceのウェブサイトへリンクします）

関連情報

• Pippin family のアプリケーションとプロトコルはこちら
• PacBioユーザー様向け情報はこちら
  （Sage Scienceのウェブサイトへリンクします）

NGSプロトコル採用実績

Pacific Biosciences社のHigh Fidelity Long Read Sequencing用のプロトコルでサイズセレクションの必要機器として採用されました。

2019年4月公開 PN 101-714-400-01

 

上記アプリケーションの論文は下記になります。

“Highly-accurate long-read sequencing improves variant detection and assembly of a human genome”

 

仕様

製品内容

• 本体
• モニター
• キーボード
• マウス

※CPUが本体に内蔵されているため、別途PCをご準備いただく必要はございません。

関連製品

• セージエルフ™専用 アガロースゲルカセット / 試薬