特長
- 煩雑なマニュアルでのゲル抽出操作が不要となり、実作業時間の短縮を実現
- より狭い分布のDNA断片の抽出が可能
- 低分子DNAのコンタミを減少させることで、無駄なリードや不明瞭な判定を減らし、シーケンス効率がアップ
- ゲルカセットの各レーンが独立しているため、泳動中の拡散によるサンプル間のコンタミリスクが発生しない
- メーカー保証期間:2年間
アプリケーション
- メイトペアシーケンスライブラリー作製
- PacBio Sequel ライブラリー作製(専用プロトコルを使用)
- 10×Genomics® Chromium™ ライブラリー作製(専用プロトコルを使用)
- Oxford Nanopore ライブラリー作製
ゲルカセット各種
ゲルカセット | 目的のサイズレンジ |
---|---|
3.0% アガロース | 100 bp - 250 bp |
2.0% アガロース | 100 bp - 600 bp |
1.5% アガロース | 250 bp - 1.5 kb |
0.75% アガロース | 1 kb - 18 kb |
BluePippin専用ゲルカセット・DNAコントロールキット・試薬キット
製品を使用されたお客様の声
『miRNA Seqのライブラリー調製では、アダプターが付与された140 bp付近のライブラリー産物のみを回収する必要があります。しかし、近接するサイズに未反応のアダプターやアダプターダイマーなど複数の産物が混在するため、目的サイズのみの単離・回収が非常に難しい工程でした。
私が使用しているmiRNA Seqキットでは、BluePippinを用いた単離・回収が推奨されていたこともあってデモ機をお借りしてサイズセレクションを行ってみました。
その結果、目的のサイズ域がきれいに精製され、量も確保できまして、無事にシーケンスができました。miRNA sequencingを行う際にはBluePippinが必須になるのではと考えております。』
(国内製薬企業研究者様より)
※その他、国内実績多数ございます。ドキュメントタブより「お客様事例」をご覧ください。
参考文献
①
Naomi Park* et al.,An improved approach to mate-paired library preparation for Illumina sequencing,
Methods in Next Generation Sequencing. Volume 1, Pages 10–20, ISSN (Online) 2084-7173, DOI: 10.2478/mngs-2013-0001, July 2013
*Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, UK.
「Illumina社次世代シーケンシングにおけるメイトペア・ライブラリー調製法の改良」
②
Modified Mate-Pair Protocol Lowers Cost, Boosts Library Yield
著者である理化学研究所 ライフサイエンス技術基盤研究センター(CLST)分子配列比較解析ユニット
工樂 樹洋様よりコメントを頂戴しました。
「コストがかかり不安の多いメイトペアライブラリ作成の負担を軽減するプロトコルを提案。
サイズセレクションにはBluePippinを使用。」
関連製品
- ゲルカセット・DNAコントロールキット・試薬キット(ブルーピッピン用)
- Pippin Prep(回収DNAフラグメントサイズ 100 bp - 1.5 kb)
関連情報
仕様
仕様 | Blue Pippin | Pippin Prep |
泳動方式 | 定電圧電気泳動 パルスフィールド電気泳動 |
定電圧電気泳動 |
泳動時間(目安) (目的サイズによって異なります) |
30分~10時間 | 50分~3時間 |
最大サンプル添加量 | 5 µg(断片化gDNA) | 5 µg(断片化gDNA) |
本体仕様 | Blue Pippin | Pippin Prep |
蛍光検出 | 励起波長:470 nm | 励起波長:535 nm |
検出波長:525 nm | 検出波長:640 nm | |
サイズ(W×D×H) | 280×530×180 mm | |
重量 | 7 kg | |
電源 | 100-240 VAC、2.5 A、50/60 Hz |
製品内容
- 本体
- モニター
- キーボード
- マウス
※CPUが本体に内蔵されているため、別途PCをご準備いただく必要はございません。