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製品概要

特長

次世代シーケンサー用DNAフラグメント調製に最適!

●煩雑なマニュアルでのゲル抽出操作が不要となり、実作業時間の短縮を実現します。
●より狭い分布のDNA断片の抽出が可能です。
●低分子DNAのコンタミを減少させることで、無駄なリードや不明瞭な判定を減らし、シークエンス効率がアップします。
●ゲルカセットの各レーンが独立しているため、泳動中の拡散によるサンプル間のコンタミリスクが発生しません。
●メーカー保証期間: 2年間
 

Pippinシリーズが有用な次世代シークエンスアプリケーション

●ペアエンドシークエンスライブラリー作製
●ChiP-Seqライブラリー作製
●miRNAライブラリー作製
●メイトペアシークエンスライブラリー作製

ゲルカセット各種

ゲルカセット

目的のサイズレンジ
3.0% アガロース 100bp - 250bp
2.0% アガロース 100bp - 600bp
1.5% アガロース 250bp - 1.5kb
0.75% アガロース 1kb - 18kb


▶▶ BluePippin専用ゲルカセット・DNAコントロールキット・試薬キット

製品を使用されたお客様の声

『miRNA Seqのライブラリー調製では、アダプターが付与された140bp付近のライブラリー産物のみを回収する必要があります。しかし、近接するサイズに未反応のアダプターやアダプターダイマーなど複数の産物が混在するため、目的サイズのみの単離・回収が非常に難しい工程でした。
私が使用しているmiRNA Seqキットでは、BluePippinを用いた単離・回収が推奨されていたこともあってデモ機をお借りしてサイズセレクションを行ってみました。
その結果、目的のサイズ域がきれいに精製され、量も確保できまして、無事にシーケンスができました。miRNA sequencingを行う際にはBluePippinが必須になるのではと考えております。』
(国内製薬企業研究者様より)

※その他、国内実績多数ございます。「アプリケーションノート」タブよりご覧ください。

参考文献


Naomi Park* et al,
An improved approach to mate-paired library preparation for Illumina sequencing,
Methods in Next Generation Sequencing. Volume 1, Pages 10–20, ISSN (Online) 2084-7173, DOI: 10.2478/mngs-2013-0001, July 2013

*Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, UK.
「Illumina社次世代シーケンシングにおけるメイトペア・ライブラリー調製法の改良」

この論文のリンク先はこちらになります。このページから直接ダウンロードできます。


Modified Mate-Pair Protocol Lowers Cost, Boosts Library Yield
著者である理化学研究所 ライフサイエンス技術基盤研究センター(CLST)分子配列比較解析ユニット
工樂 樹洋様よりコメントを頂戴しました。
「コストがかかり不安の多いメイトペアライブラリ作成の負担を軽減するプロトコールを提案。
サイズセレクションにはBluePippinを使用。」

【関連製品】(Sage Scienceのウェブサイトへリンクします)
●本製品用アガロースゲルカセット の詳細はこちら
●回収DNAフラグメントサイズ 100bp - 1.5kb の Pippin Prep の詳細はこちら

【関連情報】(Sage Scienceのウェブサイトへリンクします)
●Pippin family のアプリケーションとプロトコルはこちら
●PacBioユーザー様向け情報はこちら

 

保証延長サービス

当製品は保証期間を一年単位で延長するサービスをご利用いただけます。

 

詳細は下記をご覧ください。

 

▶▶ 保証期間延長サービス

仕様

仕様 Blue Pippin Pippin Prep
泳動方式 定電圧電気泳動
パルスフィールド電気泳動
定電圧電気泳動
泳動時間(目安)
(目的サイズによって異なります)
30分~10時間 50分~3時間
最大サンプル添加量 5μg(断片化gDNA)

5μg(断片化gDNA)

 

本体仕様 Blue Pippin Pippin Prep
使用電源 100-240V(Constant) 2.5A / 50-60Hz
蛍光検出 励起波長:470nm 励起波長:535nm
検出波長:525nm 検出波長:640nm
寸法 W 280 x D 530 x H 180mm
重量 7kg

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※冷凍品(-20℃)に関しては、原則として休前日(金曜日など)の出荷を行っておりませんのでご了承ください。(一部販売店様向けを除く)

CatNo.概要単位価格在庫
BLU0001 Blue Pippin本体 (17インチモニター、キーボード、マウス付属) 1 お問い合わせください 受注発注品 返品不可

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アプリケーションノート

FAQ

トラブル
シュート
ライブラリー増幅後に、3.0% ゲルカセット、Internal Standard Q3(マーカー)を使用して分画および回収を試みましたが、マーカーが検出されませんでした。 どのような原因が考えられますか?
泳動前に精製が行われていることをご確認ください。
弊社の経験として、ライブラリー増幅後に未精製のまま泳動をしたことが原因でInternal Standard(マーカー)の検出ができなかった事例がございます。
この場合、泳動時にプライマーやアダプターのダイマーがInternal Standard(マーカー)と干渉してしまい、マーカーのピーク検出を妨げたと考えられます。
使用方法・
技術的内容

Blue Pippinを使用して、

抽出したDNAが高分子であるか、分解があるかなどの品質を調べるために

パルスフィールド電気泳動を行いたいと考えています。

本製品は、このような使用方法に適していますでしょうか?

目的のDNAサイズは10-15kb以上の長鎖DNAになります。

Blue PippinはDNAの自動分取を行うための装置となっておりますので、
ご質問のような、目的用途には適しておりません。
DNAのサイズチェック及び分離を行うのであれば、同じメーカーのPippin Pulse(パルスフィールド電気泳動パワーサプライ)の方が適しております。


Pippin Pulseを用いた長鎖DNAのチェック実用例は以下の資料をご確認下さい。
https://n-genetics.com/products/1275/1033/13743.pdf

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