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次世代シーケンサー用DNAフラグメント調製に最適!
●煩雑なマニュアルでのゲル抽出操作が不要となり、実作業時間の短縮を実現します。
●より狭い分布のDNA断片の抽出が可能です。
●低分子DNAのコンタミを減少させることで、無駄なリードや不明瞭な判定を減らし、シークエンス効率がアップします。
●ゲルカセットの各レーンが独立しているため、泳動中の拡散によるサンプル間のコンタミリスクが発生しません。
●メーカー保証期間: 2年間
●ペアエンドシークエンスライブラリー作製
●ChiP-Seqライブラリー作製
●miRNAライブラリー作製
●メイトペアシークエンスライブラリー作製
ゲルカセット |
目的のサイズレンジ |
3.0% アガロース | 100bp - 250bp |
2.0% アガロース | 100bp - 600bp |
1.5% アガロース | 250bp - 1.5kb |
0.75% アガロース | 1kb - 18kb |
▶▶ BluePippin専用ゲルカセット・DNAコントロールキット・試薬キット
『miRNA Seqのライブラリー調製では、アダプターが付与された140bp付近のライブラリー産物のみを回収する必要があります。しかし、近接するサイズに未反応のアダプターやアダプターダイマーなど複数の産物が混在するため、目的サイズのみの単離・回収が非常に難しい工程でした。
私が使用しているmiRNA Seqキットでは、BluePippinを用いた単離・回収が推奨されていたこともあってデモ機をお借りしてサイズセレクションを行ってみました。
その結果、目的のサイズ域がきれいに精製され、量も確保できまして、無事にシーケンスができました。miRNA sequencingを行う際にはBluePippinが必須になるのではと考えております。』
(国内製薬企業研究者様より)
※その他、国内実績多数ございます。「アプリケーションノート」タブよりご覧ください。
①
Naomi Park* et al,
An improved approach to mate-paired library preparation for Illumina sequencing,
Methods in Next Generation Sequencing. Volume 1, Pages 10–20, ISSN (Online) 2084-7173, DOI: 10.2478/mngs-2013-0001, July 2013
*Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, UK.
「Illumina社次世代シーケンシングにおけるメイトペア・ライブラリー調製法の改良」
この論文のリンク先はこちらになります。このページから直接ダウンロードできます。
②
Modified Mate-Pair Protocol Lowers Cost, Boosts Library Yield
著者である理化学研究所 ライフサイエンス技術基盤研究センター(CLST)分子配列比較解析ユニット
工樂 樹洋様よりコメントを頂戴しました。
「コストがかかり不安の多いメイトペアライブラリ作成の負担を軽減するプロトコールを提案。
サイズセレクションにはBluePippinを使用。」
【関連製品】(Sage Scienceのウェブサイトへリンクします)
●本製品用アガロースゲルカセット の詳細はこちら
●回収DNAフラグメントサイズ 100bp - 1.5kb の Pippin Prep の詳細はこちら
【関連情報】(Sage Scienceのウェブサイトへリンクします)
●Pippin family のアプリケーションとプロトコルはこちら
●PacBioユーザー様向け情報はこちら
保証延長サービス
当製品は保証期間を一年単位で延長するサービスをご利用いただけます。
詳細は下記をご覧ください。
▶▶ 保証期間延長サービス
仕様 | Blue Pippin | Pippin Prep |
泳動方式 | 定電圧電気泳動 パルスフィールド電気泳動 |
定電圧電気泳動 |
泳動時間(目安) (目的サイズによって異なります) |
30分~10時間 | 50分~3時間 |
最大サンプル添加量 | 5μg(断片化gDNA) |
5μg(断片化gDNA) |
本体仕様 | Blue Pippin | Pippin Prep |
使用電源 | 100-240V(Constant) 2.5A / 50-60Hz | |
蛍光検出 | 励起波長:470nm | 励起波長:535nm |
検出波長:525nm | 検出波長:640nm | |
寸法 | W 280 x D 530 x H 180mm | |
重量 | 7kg |
納期/出荷日について
月曜~金曜(土日祝日除く)14:30迄に販売店様よりご注文いただき弊社倉庫に在庫がある場合、基本的には当日出荷させていただきます。
弊社倉庫に在庫がない、もしくは何らかの事情で当日出荷ができない場合は、弊社よりご注文いただいた販売店様へ納期のご連絡をさせていただきます。
※冷凍品(-20℃)に関しては、原則として休前日(金曜日など)の出荷を行っておりませんのでご了承ください。(一部販売店様向けを除く)
CatNo. | 概要 | 単位 | 価格 | 在庫 |
---|---|---|---|---|
BLU0001 | Blue Pippin本体 (17インチモニター、キーボード、マウス付属) | 1 |
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Blue Pippinを使用して、
抽出したDNAが高分子であるか、分解があるかなどの品質を調べるために
パルスフィールド電気泳動を行いたいと考えています。
本製品は、このような使用方法に適していますでしょうか?
目的のDNAサイズは10-15kb以上の長鎖DNAになります。
Blue PippinはDNAの自動分取を行うための装置となっておりますので、
ご質問のような、目的用途には適しておりません。
DNAのサイズチェック及び分離を行うのであれば、同じメーカーのPippin Pulse(パルスフィールド電気泳動パワーサプライ)の方が適しております。
Pippin Pulseを用いた長鎖DNAのチェック実用例は以下の資料をご確認下さい。
https://n-genetics.com/products/1275/1033/13743.pdf
泳動後に「Current leakage test failed」というメッセージが表示されます。
どうしたらよいでしょうか?
電極が劣化しているので、修理が必要です。弊社までご連絡ください。
一般的な電気泳動槽の電極と同様で、本装置の電極も消耗部品となります。
使用回数とメンテナンス状況により、電極線が断裂したり、電極に泳動バッファーの
塩が蓄積して電極間でブリッジを形成する場合があります。
特にパルスフィールド電気泳動は電極への負荷が大きいため、ソフトウェアv6.30以降は
パルスフィールド泳動後の電極劣化のチェック機能が追加され、エラーメッセージが表示されるようになりました。
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