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ブルーピッピン

Name: ブルーピッピン
Brand: Sage Science

（BluePippin）

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製品概要

特長

次世代シーケンサー用DNAフラグメント調製に最適！

●煩雑なマニュアルでのゲル抽出操作が不要となり、実作業時間の短縮を実現します。
●より狭い分布のDNA断片の抽出が可能です。
●低分子DNAのコンタミを減少させることで、無駄なリードや不明瞭な判定を減らし、シークエンス効率がアップします。
●ゲルカセットの各レーンが独立しているため、泳動中の拡散によるサンプル間のコンタミリスクが発生しません。
●メーカー保証期間：　２年間

Pippinシリーズが有用な次世代シークエンスアプリケーション

●ペアエンドシークエンスライブラリー作製
●ChiP-Seqライブラリー作製
●miRNAライブラリー作製
●メイトペアシークエンスライブラリー作製

ゲルカセット各種

ゲルカセット	目的のサイズレンジ
3.0% アガロース	100bp - 250bp
2.0% アガロース	100bp - 600bp
1.5% アガロース	250bp - 1.5kb
0.75% アガロース	1kb - 18kb

▶▶ BluePippin専用ゲルカセット・DNAコントロールキット・試薬キット

製品を使用されたお客様の声

『miRNA Seqのライブラリー調製では、アダプターが付与された140bp付近のライブラリー産物のみを回収する必要があります。しかし、近接するサイズに未反応のアダプターやアダプターダイマーなど複数の産物が混在するため、目的サイズのみの単離・回収が非常に難しい工程でした。
私が使用しているmiRNA Seqキットでは、BluePippinを用いた単離・回収が推奨されていたこともあってデモ機をお借りしてサイズセレクションを行ってみました。
その結果、目的のサイズ域がきれいに精製され、量も確保できまして、無事にシーケンスができました。miRNA sequencingを行う際にはBluePippinが必須になるのではと考えております。』
（国内製薬企業研究者様より）

※その他、国内実績多数ございます。「アプリケーションノート」タブよりご覧ください。

参考文献

①
Naomi Park* et al,
An improved approach to mate-paired library preparation for Illumina sequencing,
Methods in Next Generation Sequencing. Volume 1, Pages 10–20, ISSN (Online) 2084-7173, DOI: 10.2478/mngs-2013-0001, July 2013

*Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, UK.
「Illumina社次世代シーケンシングにおけるメイトペア・ライブラリー調製法の改良」

この論文のリンク先はこちらになります。このページから直接ダウンロードできます。

②
Modified Mate-Pair Protocol Lowers Cost, Boosts Library Yield
著者である理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター（CLST）分子配列比較解析ユニット
工樂樹洋様よりコメントを頂戴しました。
「コストがかかり不安の多いメイトペアライブラリ作成の負担を軽減するプロトコールを提案。
サイズセレクションにはBluePippinを使用。」

【関連製品】（Sage Scienceのウェブサイトへリンクします）
●本製品用アガロースゲルカセットの詳細はこちら
●回収DNAフラグメントサイズ 100bp - 1.5kb の Pippin Prep の詳細はこちら

【関連情報】（Sage Scienceのウェブサイトへリンクします）
●Pippin family のアプリケーションとプロトコルはこちら
●PacBioユーザー様向け情報はこちら

保証延長サービス

当製品は保証期間を一年単位で延長するサービスをご利用いただけます。

詳細は下記をご覧ください。

▶▶　保証期間延長サービス

仕様

仕様	BluePippin	Pippin Prep
泳動方式	定電圧電気泳動パルスフィールド電気泳動	定電圧電気泳動
泳動時間（目安）（目的サイズによって異なります）	30分～10時間	50分～3時間
最大サンプル添加量	5μg（断片化gDNA）	5μg（断片化gDNA）

本体仕様	BluePippin	Pippin Prep
使用電源	100-240V（Constant） 2.5A / 50-60Hz
蛍光検出	励起波長：470nm	励起波長：535nm
蛍光検出	検出波長：525nm	検出波長：640nm
寸法	W 280 x D 530 x H 180mm
重量	7kg

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弊社倉庫に在庫がない、もしくは何らかの事情で当日出荷ができない場合は、弊社よりご注文いただいた販売店様へ納期のご連絡をさせていただきます。
※冷凍品（-20℃）に関しては、原則として休前日（金曜日など）の出荷を行っておりませんのでご了承ください。（一部販売店様向けを除く）

CatNo.	概要	単位	価格	在庫
BLU0001	BluePippin本体　（17インチモニター、キーボード、マウス付属）	1

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製品カタログ

FAQ

トラブル シュートライブラリー増幅後に、3.0% ゲルカセット、Internal Standard Q3（マーカー）を使用して分画および回収を試みましたが、マーカーが検出されませんでした。どのような原因が考えられますか？: 泳動前に精製が行われていることをご確認ください。
弊社の経験として、ライブラリー増幅後に未精製のまま泳動をしたことが原因でInternal Standard（マーカー）の検出ができなかった事例がございます。
この場合、泳動時にプライマーやアダプターのダイマーがInternal Standard（マーカー）と干渉してしまい、マーカーのピーク検出を妨げたと考えられます。

トラブル シュート 泳動後に「Current leakage test failed」というメッセージが表示されます。 どうしたらよいでしょうか？: 電極が劣化しているので、修理が必要です。弊社までご連絡ください。
一般的な電気泳動槽の電極と同様で、本装置の電極も消耗部品となります。
使用回数とメンテナンス状況により、電極線が断裂したり、電極に泳動バッファーの
塩が蓄積して電極間でブリッジを形成する場合があります。
特にパルスフィールド電気泳動は電極への負荷が大きいため、ソフトウェアv6.30以降は
パルスフィールド泳動後の電極劣化のチェック機能が追加され、エラーメッセージが表示されるようになりました。

使用方法・ 技術的内容 長鎖DNAの抽出で、High-Pass プログラムを使用しています。 どのくらい少ないDNA量で使用できるでしょうか？ また回収率はどのくらいでしょうか？

High-Pass プログラムでは、インプットDNA量は数μgが望ましいですが、
少なくとも500ng以上を推奨しています。

ただし、回収率はインプットDNA中にターゲットサイズがどの程度含まれているかに依存します。
そのため適切なインプットDNA量やターゲットサイズの回収率を見積もるためには、
あらかじめインプットDNAの分布を適切な手法で確認することが重要です。
DNA分布の確認は、Pippin PulseやCHEF-Mapperなどのパルスフィールド電気泳動で実施いただくことをお勧めします。
TapeStationやBiopanalyzerなどのマイクロ流路型電気泳動ではスメアDNAを
泳動した場合に、テーリングが発生して存在しない高分子が検出されることがありますので、お勧めできません。

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