16S rRNA解析 （V1＆V2領域）

■サービス概要

本16S rRNA解析は、SheepMedical社の一般向けサービス『菌ドック』を、リサーチ向けに展開したNGS受託サービスです。サンプルの抽出からシーケンス、データ解析までを一括で対応させていただく、パッケージプランとなっています。
短納期、低価格、豊富なオプションにて、サービスをご提供させていただきます。

 

■サービス仕様

• シーケンサー：Ion S5
• チップ：Ion 530
• 1サンプルあたりの取得データ量：3万~10万 Reads
• 納品方法：解析結果（エクセルデータ）
• 対応サンプル：糞便、唾液 など 
• データ解析内容：イオンリポーターでのQIIMEを用いた解析
  MicroSEQとGreenGenesでの細菌種のアサイン → デモレポートはこちらからご確認ください。
• オプションサービス：上記のサービス仕様以外でも、オプション対応が可能です。お気軽にお問い合わせください。

オプション例）

• BAM、FASTQの納品
• 糞便、唾液以外でのサンプル提出
• 上記以外のデータ解析

■ライブラリー調製方法

V1＆V2領域をPCRで増幅後、ライブラリー調製を行います。

 

■サンプルの採取・発送方法

発送ガイドをご参照ください。
糞便、唾液からのご依頼をご希望の場合は、専用の採取キットを送付させていただきます。

 

■納期

委託先でサンプル受け取り後、抽出を含めて4-6週で納品。