KAPA HyperPETE カスタムパネル
KAPA HyperPETE Custom Panel
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KAPA HyperPETEカスタムパネルは、自由に設定したヒトターゲット遺伝子（領域）に対する最適化済みKAPA HyperPETE用キャプチャープライマー＆リリースプライマーのセットです。
・KAPA HyperPETE Choice：HyperDesignツールで設計するカスタムパネル
・KAPA HyperPETE Explore：HyperDesignツール経由で依頼するRoche社デザイナーが設計するカスタムパネル
特長
KAPA HyperPETEワークフローはPETE（Primer Extension Target Enrichment）反応を応用したターゲット領域を効率良くNGS解析するためのエンリッチメント法のひとつで、ハイブリダイゼーション法に匹敵するパフォーマンスをアンプリコン法に匹敵するワークフロー時間で達成します。このKAPA HyperPETEでは、自身の研究テーマの沿ったヒト遺伝子パネル上の遺伝子をキャプチャーするために、キャプチャープライマー＆リリースプライマーをカスタムデザインすることができるようになっています。
KAPA HyperPETE Choice Panel及びKAPA HyperPETE Explore Panelは、250Kbまでのカスタムターゲット上の、低頻度のSNV、Indel、（CNV）を解析するために使用するカスタムデザインパネルです。デザインする際には、FFPE組織サンプルから取得した DNAで行われるマイクロサテライト不安定性(MSI)領域をオプションとして選択することもできるようになっています。
KAPA HyperPETE Choice RNA Panel及びKAPA HyperPETE Explore RNA Panelは既知または新規のRNA融合遺伝子解析のために使用するカスタムデザインパネルです。50Kbまでのターゲットをデザインすることが可能で、内部コントロールとして4つのハウスキーピング遺伝子もカバーされます。
これらは、それぞれの検体種（FFPE DNA／cfDNA／FFPE RNA／gDNA）に最適化されたプロトコールに従って、KAPA HyperPETE Reagent Kitと併せてご使用ください。
HyperDesign ツール(プローブデザインツール）
カスタムデザインには、KAPA HyperCapture（KAPA HyperChoice Kit, KAPA HyperExplore Kit) のデザインにも使用される、オンラインツール『Hyper Design』で行います。直感的で使いやすいインターフェースとロシュ社独自のアルゴリズムにより、少ないリード数でより深く均一なカバレッジを実現するためのデザインが、プローブデザインが初めての方や専門の知識をお持ちでない方でも容易に得ることができます。また、購入前にデザインをレビューできるので安心してご使用いただけます。
仕様
KAPA HyperPETE Choice
| 製品 | 構成内容 | 入数 | 内容量 |
|---|---|---|---|
|
75 KB、96反応（09418741001） 150 KB、96反応（09418806001） 250 KB、96反応（09418873001） RNA 50 KB、96反応（09418938001） |
Choice Capture Panel | 1 | 480 µL |
| Choice Release Panel | 1 | 960 µL | |
|
75 KB、384反応（09418776001） 150 KB、384反応（09418849001） 250 KB、384反応（09418903001） RNA 50 KB、384反応（09418962001） |
Choice Capture Panel | 4 | 480 µL |
| Choice Release Panel | 4 | 960 µL | |
|
75 KB、1536反応（09418784001） 150 KB、1536反応（09418857001） 250 KB、1536反応（09418911001） RNA 50 KB、1536反応（09418989001） |
Choice Capture Panel | 16 | 480 µL |
| Choice Release Panel | 16 | 960 µL |
KAPA HyperPETE Explore
| 製品 | 構成内容 | 入数 | 内容量 |
|---|---|---|---|
|
75 KB、96反応（09419004001） 150 KB、96反応（09419071001） 250 KB、96反応（09419136001） RNA 50 KB、96反応（09419209001） |
Explore Capture Panel | 1 | 480 µL |
| Explore Release Panel | 1 | 960 µL | |
|
75 KB、384反応（09419047001） 150 KB、384反応（09419101001） 250 KB、384反応（09419179001） RNA 50 KB、384反応（09419233001） |
Explore Capture Panel | 4 | 480 µL |
| Explore Release Panel | 4 | 960 µL | |
|
75 KB、1536反応（09419055001） 150 KB、1536反応（09419110001） 250 KB、1536反応（09419187001） RNA 50 KB、1536反応（09419241001） |
Explore Capture Panel | 16 | 480 µL |
| Explore Release Panel | 16 | 960 µL |
- 包装サイズ、ターゲットの大きさ、アプリケーション（DNA/RNA）に関わらず納期は5～6週間かかります。
- 保存温度：-15℃～-25℃
- 使用期限：ラベル記載に準ずる
※注意事項※
室温（～25℃）以上の温度に長時間さらさないでください。