KAPA HyperPETE カタログパネル
KAPA HyperPETE Catalog Panel
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KAPA HyperPETEカタログパネルは、疾患関与の遺伝子を的確にキャプチャーするためにデザインされたKAPA HyperPETE用キャプチャープライマー&リリースプライマーセットです。目的に応じた5つの遺伝子パネルが準備されています。
KAPA HyperPETEカタログパネルは、疾患関与の遺伝子を的確にキャプチャーするためにデザインされたKAPA HyperPETE用キャプチャープライマー&リリースプライマーセットです。目的に応じた5つの遺伝子パネルが準備されています。
特長
KAPA HyperPETEワークフローはPETE(Primer Extension Target Enrichment)反応を応用したターゲット領域を効率良くNGS解析するためのエンリッチメント法のひとつで、ハイブリダイゼーション法に匹敵するパフォーマンスをアンプリコン法に匹敵するワークフロー時間で達成します。
このKAPA Hyper PETEでは、5つの異なる目的に対し、すぐに利用できる固定デザインパネルを“カタログパネル”として提供しています。
KAPA HyperPETE Pan Cancer Panel
KAPA HyperPETE Pan Cancer Panelは86個のヒトがん関連遺伝子と190のMSI遺伝子座をカバーしている(ターゲットサイズ302 Kb)、汎がんの体細胞変異解析に用いるカタログパネルです。KAPA HyperPETE Somatic Tissue DNA WorkflowやKAPA HyperPETE Somatic Plasma cfDNA Workflowに従い、KAPA HyperPETE Reagent Kitと併せてご使用ください。
ターゲット遺伝子リスト |
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ABL1, AKT1, ALK, APC, ARID1A, ATM, ATR, BRAF, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CDK4, CDKN2A, CSF1R, CTNNB1, DDR2, DNMT3A, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ESR1, EZH2, FANCA, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FLT3, GNA11, GNAQ, GNAS, HNF1A, HRAS, IDH1, IDH2, JAK1, JAK2, JAK3, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, MLH1, MPL, MSH2, MSH6, MTOR, NF1, NF2, NFE2L2, NOTCH1, NPM1, NRAS, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PDGFRA, PIK3CA, PMS2, POLE, PTCH1, PTEN, PTPN11, RAD50, RAD51C, RAD51D, RAF1, RB1, RET, ROS1, SETD2, SMAD4, SMARCB1, SMO, SRC, STK11, TERT, TP53, TSC1, TSC2, VHL 及び、190のMSI遺伝子座 |
KAPA HyperPETE HotSpot Panel
KAPA HyperPETE Hot Spot Panelはヒトがん遺伝子上の変異「ホットスポット」領域を解析するためのカタログパネルで、37個の遺伝子の40 Kbをターゲットとしています。KAPA HyperPETE Somatic Tissue DNA WorkflowやKAPA HyperPETE Somatic Plasma cfDNA Workflowに従い、KAPA HyperPETE Reagent Kitと併せてご使用ください。
ターゲット遺伝子リスト |
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AKT1, ALK, APC, ATM, BRAF, BRCA1, CDKN2A, CTNNB1, EGFR, ERBB2, ESR1, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, GNA11, GNAQ, GNAS, HRAS, IDH1, IDH2, JAK2, KIT, KRAS, NF1, NRAS, NTRK3, PDGFRA, PIK3CA, POLE, PTCH1, PTEN, RET, STK11, TP53, TSC1, TSC2 |
KAPA HyperPETE Hereditary Oncology Panel
KAPA HyperPETE Hereditary Oncology Panelは遺伝性乳がん及び卵巣がんや、遺伝性大腸がんなどの遺伝性腫瘍にフォーカスしたカタログパネルで、生殖細胞変異の解析に使用します。BRCA1、BRCA2を含む、47個の遺伝性腫瘍に関連した遺伝子をカバーしています(ターゲットサイズ200 Kb)。8検体のプレプールキャプチャーが可能なKAPA HyperPETE Germline DNA Workflowに従い、KAPA HyperPETE Reagent Kitと併せてご使用ください。
ターゲット遺伝子リスト |
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APC, ATM, AXIN2, BARD1, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CDK4, CDKN2A, CHEK2, CTNNA1, DICER1, EPCAM, GREM1, HOXB13, KIT, MEN1, MLH1, MSH2, MSH3, MSH6, MUTYH, NBN, NF1, NTHL1, PALB2, PDGFRA, PMS2, POLD1, POLE, PTEN, RAD50, RAD51C, RAD51D, SDHA, SDHB, SDHC, SDHD, SMAD4, SMARCA4, STK11, TP53, TSC1, TSC2, VHL |
KAPA HyperPETE Newborn Screening Panel
KAPA HyperPETE Newborn Screening Panelは、89個の疾患遺伝子の生殖細胞変異を調べる際に使用するカタログパネルです(ターゲットサイズ290 Kb)。8検体のプレプールキャプチャーが可能なKAPA HyperPETE Germline DNA Workflowに従い、KAPA HyperPETE Reagent Kitと併せてご使用ください。
ターゲット遺伝子リスト |
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ABCD1, ACADM, ACADVL, ACAT1, ADA, AK2, ASL, ASS1, ATM, BCKDHA, BCKDHB, BLNK, BTD, BTK, CBS, CD247, CD3D, CD3E, CD3G, CD40LG, CFTR, CHD7, CORO1A, CYP11A1, CYP11B1, CYP17A1, CYP21A2, DBT, DCLRE1C, DKC1, DOCK2, DOCK8, FAH, FOXN1, GAA, GALE, GALK1, GALT, GATA2, GCDH, HADHA, HADHB, HBB, HLCS, HMGCL, HSD3B2, IDUA, IGHM, IL2RG, IL7R, IVD, JAK3, LIG4, MCCC1, MCCC2, MCEE, MMAA, MMAB, MMADHC, MMUT, MTHFD1, MTHFR, MTR, MTRR, NBN, NHEJ1, ORAI1, PAH, PAX8, PCCA, PCCB, PNP, POR, PRKDC, PTPRC, RAC2, RAG1, RAG2, RMRP, SLC22A5, SLC46A1, SMN1, STAR, STAT5B, STIM1, TBX1, TSHR, WAS, ZAP70 |
KAPA HyperPETE LC (Lung Cancer) Fusion Panel
KAPA HyperPETE LC Fusion Panel は融合遺伝子解析のためのカタログパネルで、既知または新規の融合パートナーを検出するためにRNAから解析を行います。肺がんで多く検出される17個の融合遺伝子をターゲットにした18 Kbのパネルで、内部コントロールの4つのハウスキーピング遺伝子もカバーされています。KAPA HyperPETE Tissue RNA Fusion Transcript Workflowに従い、KAPA HyperPETE Reagent Kitと併せてご使用ください。
ターゲット遺伝子リスト |
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ALK, AXL, BRAF, EGFR, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, NRG1, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PDGFRA, PDGFRB, PPARG, RET, ROS1 Housekeeping Genes: RAB7A, VCP, CHMP2A, HPRT1 |
関連製品
仕様
KAPA HyperPETE Pan Cancer Panel
製品 | 構成内容 | 入数 | 内容量 |
---|---|---|---|
24反応(09329161001) |
Pan Cancer Capture Panel | 1 | 120 µL |
Pan Cancer Release Panel | 1 | 240 µL | |
96反応(09329196001) |
Pan Cancer Capture Panel | 1 | 480 µL |
Pan Cancer Release Panel | 1 | 960 µL | |
384反応(09329226001) |
Pan Cancer Capture Panel | 4 | 480 µL |
Pan Cancer Release Panel | 4 | 960 µL |
製品 | 構成内容 | 入数 | 内容量 |
---|---|---|---|
24反応(09329234001) |
Hot Spot Capture Panel | 1 | 120 µL |
Hot Spot Release Panel | 1 | 240 µL | |
96反応(09329277001) |
Hot Spot Capture Panel | 1 | 480 µL |
Hot Spot Release Panel | 1 | 960 µL | |
384反応(09329307001) |
Hot Spot Capture Panel | 4 | 480 µL |
Hot Spot Release Panel | 4 | 960 µL |
製品 | 構成内容 | 入数 | 内容量 |
---|---|---|---|
24反応(09329315001) |
Hereditary Onco Capture Panel | 1 | 120 µL |
Hereditary Onco Release Panel | 1 | 240 µL | |
96反応(09329340001) |
Hereditary Onco Capture Panel | 1 | 480 µL |
Hereditary Onco Release Panel | 1 | 960 µL | |
384反応(09329374001) |
Hereditary Onco Capture Panel | 4 | 480 µL |
Hereditary Onco Release Panel | 4 | 960 µL |
製品 | 構成内容 | 入数 | 内容量 |
---|---|---|---|
24反応(09329382001) |
Newborn Screening Capture Panel | 1 | 120 µL |
Newborn Screening Release Panel | 1 | 240 µL | |
96反応(09329439001) |
Newborn Screening Capture Panel | 1 | 480 µL |
Newborn Screening Release Panel | 1 | 960 µL | |
384反応(09329463001) |
Newborn Screening Capture Panel | 4 | 480 µL |
Newborn Screening Release Panel | 4 | 960 µL |
製品 | 構成内容 | 入数 | 内容量 |
---|---|---|---|
24反応(09329471001) |
Lung Cancer Fusion Capture Panel | 1 | 120 µL |
Lung Cancer Fusion Release Panel | 1 | 240 µL | |
96反応(09329501001) |
Lung Cancer Fusion Capture Panel | 1 | 480 µL |
Lung Cancer Fusion Release Panel | 1 | 960 µL | |
384反応(09329536001) |
Lung Cancer Fusion Capture Panel | 4 | 480 µL |
Lung Cancer Fusion Release Panel | 4 | 960 µL |
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※注意事項※
室温(~25℃)以上の温度に長時間さらさないでください。