PacBio SequelⅡe バクテリア全ゲノムシーケンス（相乗りプラン）
■サービス仕様
- シーケンサー：PacBio SequelⅡe
- 納品データ：BAMファイル形式
- 納品方法： HDD納品
本サービスは、サンプル種限定の相乗りシーケンスとなります。
別サンプル種等では、対応出来ないサービスとなりますので、ご留意ください。
■サンプル要件
ライブラリー調製に使用するKitをご確認の上、下記条件のDNAをご準備ください。
| ライブラリー調製キット | サンプルの状態 | サンプル量 | Average size（BP） |
|---|---|---|---|
| SMRTbell prep. kit 3.0(Microbial Library) | gDNA | 4.1 µg 以上 | 15,000bp 以上 |
※電気泳動で確認した際に分解がなく、スメアが見られないこと。
※Average SizeはFemto Pulse System(Agilent社)を使用し、DNA断片を測定した際の平均の長さとなります。
※ QCで2-3 μL使用致しますので、液量は10 μL以上を目安に多めにお送りください。
■納期
- 解析なし：6週間前後
- 解析あり：解析なしの6週間前後に加えて、以下の解析期間を要します。
・De novo Assembly：ゲノムサイズに依存します。
・バクテリアの場合：+1週間程度
■データ解析
- データ解析1（De novo Assemble）
- データ解析2（Gene Prediction/Annotation）
※データ解析2を実施する場合、データ解析1の実施が必須となります。
■デモレポート
De novo Assembly＋Annotationに関して以下をご参照ください。
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