微量RNAシーケンス

Low Input RNA Sequencing

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よくあるご質問34件

微量RNAシーケンス

 

 

 

 

■サービス仕様

  • シーケンシング:Novaseq X Plus
  • 納品データ:fastqファイル形式
    ※ Read1とRead2それぞれ作成されますので、1サンプルにつき2つのファイルを納品いたします。
  • 使用できるライブラリ調製キット
    ・SMART-Seq v4 Kit , Nextera XT DNA kit
  • 取得合計データ量が100 G base 未満の場合は、基本はクラウド納品となります。

    取得合計データ量が110 G base 以上になった場合は、HDDでの納品となります。

    また、解析ありの場合は、取得合計データ量が56 G base以上になった場合、HDDでの納品となります。

 

■サンプル要件

  • RNA量:0.01 µg以上(total RNA)
  • RIN値:7以上
  • rRNA比:1以上

※ Sample QC(Quality Check)の際に、Sampleを2-3 µL使用します。

  Sample Volumeは、余裕をもってご準備ください。

 

■対応できる解析メニュー

  • Expresion Profile  
  • Expresion Profile、DEG
  • Pathway解析(KEGG Enrichiment Analysis)
  • SNP and Indel Discovery
  • Fusion Gene Prediction Results
  • RNA-Seq De novo Assemble+Annotation
  • De novo RNA-Seq Expresion Profile、DEG

比較解析パターン数によっては、追加費用が発生する場合があります。

サンプルの⽣物種によっては対応できない場合もあります。

 

■納期

  • サンプルQC合格後6週前後

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