フォーマピュア XL DNA

FormaPure XL DNA

FormaPure XL DNAは、SPRI磁性ビーズによるFFPE組織からのDNA抽出キット。Lysis工程の改良により10 µm切片7枚まで抽出することが可能

特長

  • 高品質:次世代シーケンスに求められる品質に適合するDNA
  • 高収量:さまざまなFFPE組織からDNAを収量よく抽出
  • 簡便な実験:SPRI磁性ビーズによるDNA抽出ワークフロー

概要

表1)高品質:次世代シーケンスに求められる品質に適合するDNA

表1)FormaPure XL DNAで抽出したDNAで次世代シーケンスを行った際の、低頻度バリアントの検出例
FormaPure XL DNAで抽出したDNAをサンプルとして次世代シーケンス解析を行った結果、低頻度バリアント(変異)も安定して検出可能であることがわかります。FormaPure XL DNAは、FFPE組織からのDNA抽出時にバイアスがかかりづらい特徴があり、次世代シーケンスのDNAサンプル調製に適していることを示します。

 

 

表2)高収量:さまざまなFFPE組織からDNAを収量よく抽出

表2)さまざまな保存年数およびがん由来の10 μm FFPE組織切片からのDNA収量
DNA定量は、PicoGreen蛍光測定により行いました。FormaPure XL DNAは、乳がん、肝細胞がん、肺がん、胃がん、結腸がん由来の長期保存FFPE組織からでも、高収量でDNAを抽出可能であることを示します。

 

 

 

図1)簡便な実験:SPRI磁性ビーズによるDNA/RNA抽出ワークフロー

図1)FormaPure XL DNAの抽出ワークフロー

  1. Mineral Oilを加え加熱し、パラフィンを溶解
  2. Lysis、Proteinase Kを加え組織消化
  3. 加熱し脱クロスリンク
  4. RNase A処理
  5. Bindを加え、DNAをSPRI磁性ビーズに結合
  6. エタノールで洗浄
  7. Washで洗浄
  8. エタノールで洗浄
  9. 溶出

キット内容

  • Mineral Oil
  • Lysis LBD (FormaPure XL DNAの場合)
  • Lysis LBA (FormaPure DNAの場合)
  • Bind BBA
  • Wash WBA
  • RNase A
  • Proteinase K

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