フォーマピュア XL DNA
FormaPure XL DNA
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FormaPure XL DNAは、SPRI磁性ビーズによるFFPE組織からのDNA抽出キット。Lysis工程の改良により10 µm切片7枚まで抽出することが可能
特長
- 高品質:次世代シーケンスに求められる品質に適合するDNA
- 高収量:さまざまなFFPE組織からDNAを収量よく抽出
- 簡便な実験:SPRI磁性ビーズによるDNA抽出ワークフロー
概要
表1)高品質:次世代シーケンスに求められる品質に適合するDNA
表1)FormaPure XL DNAで抽出したDNAで次世代シーケンスを行った際の、低頻度バリアントの検出例
FormaPure XL DNAで抽出したDNAをサンプルとして次世代シーケンス解析を行った結果、低頻度バリアント(変異)も安定して検出可能であることがわかります。FormaPure XL DNAは、FFPE組織からのDNA抽出時にバイアスがかかりづらい特徴があり、次世代シーケンスのDNAサンプル調製に適していることを示します。
表2)高収量:さまざまなFFPE組織からDNAを収量よく抽出
表2)さまざまな保存年数およびがん由来の10 μm FFPE組織切片からのDNA収量
DNA定量は、PicoGreen蛍光測定により行いました。FormaPure XL DNAは、乳がん、肝細胞がん、肺がん、胃がん、結腸がん由来の長期保存FFPE組織からでも、高収量でDNAを抽出可能であることを示します。
図1)簡便な実験:SPRI磁性ビーズによるDNA/RNA抽出ワークフロー
図1)FormaPure XL DNAの抽出ワークフロー
- Mineral Oilを加え加熱し、パラフィンを溶解
- Lysis、Proteinase Kを加え組織消化
- 加熱し脱クロスリンク
- RNase A処理
- Bindを加え、DNAをSPRI磁性ビーズに結合
- エタノールで洗浄
- Washで洗浄
- エタノールで洗浄
- 溶出
キット内容
- Mineral Oil
- Lysis LBD (FormaPure XL DNAの場合)
- Lysis LBA (FormaPure DNAの場合)
- Bind BBA
- Wash WBA
- RNase A
- Proteinase K