フォーマピュア XL Total
FormaPure XL Total
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FormaPure XL Totalは、SPRI磁性ビーズによるFFPE組織からのDNA/RNA抽出キット。Lysis工程の改良により10 µm切片7枚まで抽出することが可能
特長
- 高完全性：他社製品より分解の少ないRNA
- 高品質：次世代シーケンスに求められる品質に適合するDNA
- 高収量：同一サンプルからDNAとRNAの両方を収量よく抽出
- 簡便な実験：SPRI磁性ビーズによるDNA/RNA抽出ワークフロー
概要
図１）高完全性：他社製品より分解の少ないRNA
図１）各がん組織由来のFFPEから抽出したRNAの完全性（RNAの分解程度）比較
FormaPure XL Total、他社カラム式抽出キットを使用して、乳がん、大腸がん、肝細胞がん、肺がん由来の10 µm FFPE組織切片各1枚からRNA抽出を行いました。RNAの完全性の評価には、Fragment Analyzer (Advanced Analytical) を使用しました。
各がん組織からFormaPure XL Totalで抽出したRNA（青色）は、他社カラム式抽出キット（オレンジ色）よりフラグメントサイズが大きく、分解の少ないRNAの抽出が可能であることを示します。DV200の値は、200 ntを超えるRNA量のパーセンテージを示します。
表１）高品質：次世代シーケンスに求められる品質に適合するDNA
表１）FormaPure XL Totalで抽出したDNAで次世代シーケンスを行った際の、低頻度バリアントの検出例
FormaPure XL Totalで抽出したDNAをサンプルとして次世代シーケンス解析を行った結果、低頻度バリアント（変異）も安定して検出可能であることがわかります。
FormaPure XL Totalは、FFPE組織からのDNA抽出時にバイアスがかかりづらい特徴があり、次世代シーケンスのDNAサンプル調製に適していることを示します。
表２）高収量：同一サンプルからDNAとRNAの両方を収量よく抽出
表２）さまざまな保存年数およびがん由来の10 μm FFPE組織切片からの核酸収量
核酸定量は、それぞれPicoGreen (DNA), RiboGreen (RNA) 蛍光測定により行いました。
FormaPure XL Totalは、乳がん、肝細胞がん、肺がん、胃がん、結腸がん由来の長期保存FFPE組織からでも、高収量でDNAとRNAを抽出可能であることを示します。
図２）簡便な実験：SPRI磁性ビーズによるDNA/RNA抽出ワークフロー
図２）FormaPure XL TotalのDNA/RNA抽出ワークフロー
- 80℃で脱パラフィン
- 55℃で組織溶解／脱クロスリンク
- RNA抽出用サンプルの取り出し
- 核酸の磁性ビーズへの結合
- 80%エタノール洗浄
- DNase I 処理
- RNAの磁性ビーズへの再結合
- 80%エタノール洗浄
- 精製RNAの溶出
- 80℃で追加の脱クロスリンク
- DNA抽出用サンプルの取り出し
- RNase A 処理
- DNAの磁性ビーズへの結合
- Washでの洗浄
- 80%エタノール洗浄
- 精製DNAの溶出
キット内容
- Mineral Oil
- Lysis LBD (FormaPure XL Totalの場合)
- Lysis LBA (FormaPure Totalの場合)
- Bind BBA
- Wash WBA
- Re-Bind RBA
- RNase A
- Proteinase K