特長
- 10 µm FFPE切片3枚までのRNA抽出に対応
- 次世代シーケンスに使用可能なRNA収量・精製度
- キシレン不使用で、ラボの安全性に寄与
- 96ウェルプレートフォーマットで、脱クロスリンクから精製までの処理が可能なため、簡単にスループットを向上させることが可能
概要
さまざまな組織の長期保存FFPEサンプルからRNA抽出
FormaPure RNAはさまざまな組織の長期保存FFPEサンプルからでも高収率でRNAを抽出精製できます。各組織（ヒト乳がん組織、ヒト大腸がん組織、ヒト肝臓がん組織、ヒト肺がん組織）のFFPEサンプルから抽出したRNA量を測定しました（表1）。
【表1】さまざまな保存年数およびがん組織由来のFFPEサンプル各10 µm 切片1枚あたりのRNA収量（ng）
RNA定量はRiboGreen蛍光測定により行った。
各組織のFFPEサンプルから断片長が大きい高品質なRNAを抽出
FormaPure RNAはさまざまな組織のFFPEサンプルから、切断の少なく断片長が大きいRNAを抽出精製できます。各組織（ヒト乳がん組織、ヒト大腸がん組織、ヒト肝臓がん組織、ヒト肺がん組織）のFFPEサンプルから抽出したRNAのフラグメントサイズを、
FormaPure RNAと他社製品で比較したところ、FormaPure RNAのほうが200 nt以上の割合が大きく、断片化の少ない高品質なRNAが抽出されました（図1）。
【図1】FormaPure RNAによる、分解の少ないRNAの抽出
4種類のFFPEがん組織から抽出したRNAの断片サイズを、Fragment Analyzer (Advanced Analytical)で解析しました。
FormaPure RNAで抽出したRNAは青色、他社製品で抽出したRNAはオレンジ色。DV200の値は、200 ntを超えるRNA量のパーセンテージを示します。
大量処理も可能な効率の良いプロセス
FormaPure RNAは磁性ビーズを用いており、96ウェルベースでの大量処理にも適しています。
ベックマン・コールター社の自動分注機Biomekシリーズによる自動化も可能です。Biomek i-Seriesを用いれば、96サンプルからのRNA抽出を、脱パラフィンを含めたハンズオン30分の、約5.5時間で処理可能です。
実験ステップ
1：Mineral Oilを加え加熱し、パラフィンを溶解
2：Lysis、Proteinase Kを加え組織消化
3：Bindを加え、核酸をSPRI磁性ビーズに結合
4：エタノールで洗浄
5：DNase I 処理
6：Re-Bindを加え、RNAをSPRI磁性ビーズに再結合
7：エタノールで洗浄
8：溶出液を加える
9：精製RNAを回収
アプリケーション
構成内容
- Mineral Oil (MO)
- Lysis (LBA)
- Bind (BBA)
- Re-Bind (RBA)