KAPAピュアビーズ

特長

• 反応液量に合わせて調整可能で、一貫した結果が得ることが可能
• 高回収率：1回のクリーンアップで1本鎖および2本鎖DNA 1 ng～5 μgが回収可能
• 迅速で効率的なクリーンアップ：反応液中の不要な成分を除去可能
• ワークフローへの容易な置き換え：既存の磁気ビーズと同じ条件で使用可能
• サイズセレクションでDNAサイズが調整可能
• 自動化に適応可能

KAPA Pure Beadsを用いたDNAおよびRNAライブラリー調製ワークフローにおけるクリーンアップおよびサイズセレクション

NGSワークフローへのシームレスな統合

• すべてのKAPA DNAおよびRNAライブラリー調製プロトコルに対応
• Agencourt®AMPure®XP *と同等の収量とサイズ分布を実現
• 既存の自動化アプリケーションにすぐに適用可能
  *ファイル上のデータ

 

KAPA Pure Beadsは、DNAおよびRNA NGSライブラリー構築ワークフローの両方でAgencourt®AMPure®XP試薬と同等の性能を発揮します。

ライブラリーは、KAPA HyperPlus Kit（A）を用いて100 ngの高品質大腸菌gDNAから、またはRiboErase（B）を用いてKAPAストランドRNA-Seqキットを用いて100 ngのUniversal Human Reference（UHR）RNAから調製しました。

ライブラリー収量は、コアとなるライブラリー構築プロセスの最後に（すなわち、ライゲーション、ライブラリー増幅前に）KAPAライブラリー定量キットを用いて決定され、ライブラリー構築効率の指標とされました。
エレクトロフェログラムは、Aglient Bioanalyzer 2100高感度DNAキットを用いて「増幅後のライブラリー」を示したものです。

調整可能で再現性の高いサイズセレクション

• 一貫したライブラリーサイズ分布が得られます。
• ライブラリー構築中のさまざまな時点で柔軟に使用可能です。
• 望ましいライブラリーサイズを達成するために、サイズセレクションのパラメーターが調整可能です。

  

KAPA Pure Beadsは再現性の高い最終ライブラリーサイズ分布をもたらします。

すべてのライブラリーは、Covaris®E220 Focused Ultrasonicatorで断片化した1 μgの高品質大腸菌ゲノムDNAからKAPA Hyper Prep Kitを用いて調製しました。
断片化パラメータは、モードフラグメント長が350 - 450 bpの範囲になるよう最適化されました。
KAPA Pure Beads（A）またはAgencourt®AMPure®XP試薬（B)のいずれかを使用して、２サイクルのライブラリー増幅後にサイズ選択（0.6X〜0.8X）を行いました。

 

NGSライブラリー構築ワークフローのさまざまな時点でサイズセレクションの調整が可能です。

すべてのライブラリーは、Covaris E220 Focused Ultrasonicatorで断片化した100 ngの高品質ヒトゲノムDNAから、KAPA Hyper Prep Kitを使用して調製しました。
断片化パラメーターは、350〜450 bpの範囲のモードフラグメントサイズに合わせて最適化しました。
（A)サイズセレクションがDNA断片化後またはライブラリー構築（アダプター連結）後に直ちに行われるかどうかにかかわらず、同等の最終ライブラリーサイズ分布が達成されました。しかしながら、サイズセレクションのパラメーターは、DNAがアダプターを含むか否かを考慮して調節されなければなりません。
（B)ライブラリー構築ワークフローの特定のポイントで異なるサイズセレクションのパラメータを使用することで、異なる最終ライブラリサイズ分布を実現できました。最初のサイズカットの比率が低いと、断片が長くなります。一方、最初のサイズカットの比率が高いと、より短いライブラリー分子を選択します。