ライトサイクラー 480 ソフトウェア
LightCycler® 480 Gene Scanning Software
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高解像度での融解曲線分析法に基づいたジーンスキャニングを行うためのLightCycler® 480専用ソフトウエアモジュール
特長
- ライトサイクラー 480 High Resolution Melting マスター(Cat. No. 04909631001)試薬を使用した融解曲線分析データを解析し、遺伝的多様性(例: SNP、変異、メチル化)が存在するPCR産物をスキャンするためのソフトウェア
製品概要
LightCycler® 480ソフトウェアは、融解曲線を型別にグループ分けする独自のアルゴリズムをベースとしたソフトウェアです。
グループ分けは自動または既知配列のスタンダードサンプルに基づいて行われます。グループ分けが行われる前に、融解曲線の生データは3ステップの処理が行われます:(1)normalization, (2)temperature-shifting, (3)difference-plotting.
背景
遺伝子スキャニングとは、PCRの増幅産物内における未知の遺伝子型(SNP、変異、欠失)を探ることです。LightCycler® 480システムを使用した遺伝子スキャニングは、高分解能の融解曲線分析をベースにしています。
この高分解能融解曲線分析(High Resolution Meliting:HRM)法では、2倍体における未知の配列バリエーションをホモ(野生型や変異型)とヘテロ融解曲線がわずかに異なる波形を示すことを利用して、区別します。
製品内容
- LightCycler 480 Gene スキャニングソフトウェア CD(Ver. 1.5.1)
- LightCycler 480 Gene スキャニングソフトウェア マニュアル