微生物全ゲノムシーケンス

(Bacterial genome Sequencing)

Novogene

オーダー情報

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  • 別途送料請求あり 別途送料請求あり
  • 返品不可キャンセル・返品不可
  • CPキャンペーン価格
  • ECEC going 特別価格

納期/出荷日について

納期/出荷日について

月曜~金曜(土日祝日除く)12時迄に販売店様よりご注文いただき弊社倉庫に在庫がある場合、基本的には当日出荷させていただきます。
弊社倉庫に在庫がない、もしくは何らかの事情で当日出荷ができない場合は、弊社よりご注文いただいた販売店様へ納期のご連絡をさせていただきます。
※冷凍品(-20℃)に関しては、原則として休前日(金曜日など)の出荷を行っておりませんのでご了承ください。(一部販売店様向けを除く)

在庫情報更新日時:2022-10-02 21:50

CatNo. メーカーコード・旧型番 概要 単位 価格 在庫
NV-MBWG1 微生物全ゲノムシーケンス(1Gb/データ解析なし) 一式 ¥21,000
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NV-MBWG1PF 微生物全ゲノムシーケンス(PCR-free/1Gb/データ解析なし) 一式 ¥24,000
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*上記以外のデータ量をご希望の場合はお問合せください。
*価格には、サンプルQC、ライブラリー調製、シーケンスリード費⽤が含まれています。
データ解析
NV-MBWGBI MBWGデータ解析 一式 ¥20,000
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データ納品
NV-DDL データダウンロード費用 *100Gbまで 一式 ¥6,000
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NV-CLEAN クリーンデータ *100Gbあたり 一式 ¥6,000
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EC going 及び BPM購入システムとは?
EC going FAQ

製品概要

微生物全ゲノムシーケンス


NGS受託解析サービスのお問い合わせ・お見積りはこちらから承ります

 

 

 

■サービス仕様
・シーケンシング:illumina NovaSeq 6000 / PE150
・納品データ:fastqファイル形式
・納品方法:データダウンロード(100 Gb未満)

 

■ライブラリー調製方法
・NEBNext® Ultra DNA Library Prep Kit

 

■PCR-freeのメリットとデメリットについて

PCR-freeのメリット

・PCRエラーやバイアスを無視できる。

・Duplication Rateが低く、ターゲット領域で、均一なカバレッジが得られることが期待できる。

 

PCR-freeのデメリット

・お送りいただくDNA量が多く必要となる。

  PCRありの場合:300 ng以上(最低量)

  PCRフリーの場合:1.5 µg以上(最低量)

 

対して、PCRありの場合は、PCRエラーの影響を受ける可能性がありますが、PCR-freeよりも、少量のサンプル量からご依頼いただくことが可能です。

詳細については、サンプル要件の項をご確認ください。

 

■サンプル要件

<微生物全ゲノムシーケンス>

・DNA量:300 ng以上
・濃度:15 ng/µL以上
・液量:20 µL以上
・純度:OD260/280 = 1.8 ~ 2.0
   DNAの分解、RNAのコンタミがないこと。

 

<微生物全ゲノムシーケンス(PCR-free)>

・DNA量:1.5 µg以上
・濃度:10 ng/µL以上
・液量:20 µL以上
・純度:OD260/280 = 1.8 ~ 2.0
   DNAの分解、RNAのコンタミがないこと。

 

※本サンプル要件に記載されているサンプル量は、最低量となります。

 記載のサンプル量の2倍の量が推奨量となります。

 

■納期

<微生物全ゲノムシーケンス>

・サンプルQC合格後30営業日

 

<微生物全ゲノムシーケンス(PCR-free)>
・サンプルQC合格後20営業日

 

 

【データ解析(オプション)】

 

■MBWGデータ解析

・解析メニューは>>こちら

・納品データ見本は>>こちら

 

クリーンデータ

クリーンデータ(CatNo. NV-CLEAN)をご依頼いただくと、以下の作業を行います。

 

1)オーバラップやアダプターダイマー等により、読み取ったアダプター配列の除去。

2)低質リード(Qphred ≦ 5の塩基数が全体リードの50%以上を占めるリード)の除去。

   ※Qphred=-10log10(e)塩基配列識別の正確性を示す単位。

3)塩基配列不明(N)が10%を超えるリードの除去。

 

*クリーンデータ後のデータは、fastqファイル形式となります。

*クリーンデータ前後のデータ両方を納品させていただきます。

NGS受託解析サービスのお問い合わせ・お見積りは>>こちら<<から承ります

 

デモ・サンプル・その他お問い合わせはお気軽に

製品によってはサンプルのご用意が無い場合もございます。予めご了承ください。

お問い合わせ

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製品カタログ

FAQ

製品仕様

納品されたRawデータを、自分達の解析パイプラインで解析する予定です。
もし、解析がうまくいかなかった場合、解析サービスを後から追加でオーダーすることは可能でしょうか?

はい、可能です。

 

ただし、Rawデータをクラウドにて納品させていただいた場合では、データの保管に期限がございますので、ご留意ください。
(通常30日が保管期限となっております。別途、追加費用が必要となりますが、保管期間の延長も可能です。)

製品仕様

Rawデータをご提供して、解析サービスのみオーダーすることは可能でしょうか?

はい、Rawデータをご提供いただければ、解析を行うことは可能です。
価格は都度、ご相談ください。

製品仕様

まずは、予備実験で、read depthの浅いシーケンスを検討しています。
その後、シーケンスの結果を確認してから、ディープシーケンスをするサンプルを選択し、あらためて、追加のシーケンスを行うことは可能でしょうか?
また、結果を確認する期間、サンプルを保管していただくことは可能でしょうか?

はい。追加のシーケンスは、対応可能です。
シーケンスの結果を確認する間、ノボジーン株式会社でサンプルの保管をしておりますので、結果を確認してから、ディープシーケンスするサンプルをご選択ください。
(別途、費用がかかります。必要なデータ量とあわせて、弊社までお問合せください。)

 

ただし、サンプルの保管は、通常1か月が保管期限となっておりますので、ご留意ください。
ご連絡いただければ、保管期間を延長することも可能です。
(保管については、費用はかかりません。)

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