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Nanobind 高分子ゲノムDNA抽出キット（組織用） Nanobind 高分子ゲノムDNA抽出キット（組織用） Nanobind 高分子ゲノムDNA抽出キット（組織用）
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Nanobind 高分子ゲノムDNA抽出キット（組織用）

（Nanobind Tissue Big DNA Kit）

Pacific Biosciences of California Inc

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オーダー情報

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納期/出荷日について

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月曜～金曜（土日祝日除く）12時迄に販売店様よりご注文いただき弊社倉庫に在庫がある場合、基本的には当日出荷させていただきます。
弊社倉庫に在庫がない、もしくは何らかの事情で当日出荷ができない場合は、弊社よりご注文いただいた販売店様へ納期のご連絡をさせていただきます。
※冷凍品（-20℃）に関しては、原則として休前日（金曜日など）の出荷を行っておりませんのでご了承ください。（一部販売店様向けを除く）

在庫情報更新日時:2023-06-01 21:50

CatNo. メーカーコード・旧型番 概要 単位 価格 在庫 EC価格
NB-900-701-01 Nanobind Tissue Big DNA Kit
販売中止 		20回用 販売中止
102-302-100 NB-900-701-01 Nanobind Tissue Big DNA Kit 24回用 在庫あり

EC going 及び BPM購入システムとは？
EC going FAQ

製品概要

お知らせ

＜2022年9月12日掲載＞

この度、Pacific Biosciences of California社がCirculomics社を買収したことにより、Circulomics社製品の販売元、
型番、包装単位、および価格が変更されることとなりました。
製品をご愛顧いただいているお客様には誠に恐縮ではございますが、何卒ご理解賜りますよう宜しくお願い申し上げます。

詳しい内容につきましては、ご案内文にてご確認くださいますようお願い申し上げます。

 

変更時期：

2022年9月30日までCirculomics 社の現型番にて販売（弊社在庫がなくなり次第、新型番に切替）
2022年10月1日よりPacific Biosciences of California社の新型番にて販売

 

ご案内文はこちら＞＞こちら

 

 

ハイクオリティな高分子ゲノムDNAを最適に抽出・精製を可能にするキット

Nanobindとは？

Nanobindは、Circulomics社が独自に開発した高密度シリカのナノ構造を利用したテクノロジーです（図1）。
Nanobindテクノロジーを磁気ディスクと組み合わせることにより、従来の磁気ビーズやシリカ製スピンカラムを使用するキットでは実現できなかった、ハイクオリティな高分子(~300+ kb）または超高分子(~1+ Mb)ゲノムDNAを抽出・精製することが可能となり、第3世代シークエンス時のN50値を大幅に向上させることができます。

図1. Nanobindによる高密度シリカ表面構造のSEM画像。

サンプルタイプに応じたNanobind Big DNA Kitのラインナップ

細胞、全血、バクテリア用 組織用 植物用
Nanobind CBB Big DNA Kit Nanobind Tissue Big DNA Kit
(本製品)		 Nanobind Plant Nuclei Big DNA Kit

Nanobind Tissue Big DNA Kitの特長

  • 高分子ゲノムDNA抽出キット（組織用［哺乳類、魚類、鳥類、軟体動物、甲殻類など］）
  • ハイクオリティな高分子ゲノムDNA(50 kb – 300+ kb)抽出キット
  • 第3世代ロングリードシークエンス時のN50値を大幅に向上
  • 本製品は組織用です。
    （細胞・全血・バクテリア、植物に使用可能なラインナップもございます。詳しくは上記ラインナップをご覧ください。）

期待される収量

ゲノムDNAのサイズは、サンプルの種類、初発サンプルの品質、および処理パラメータにより異なります。（図2）。
当キットのプロトコルは通常、50 kb〜300 kbのサイズ範囲のDNAを取得することができます。

図2.Nanobind Tissue Big DNAを使用して様々な組織から抽出したDNAのパルスフィールドゲル電気泳動（PFGE）の比較。

サンプルと期待収量

次の表は、さまざまな動物種および組織タイプからの抽出データを示しています（図3）。
全てのサンプルは、PacBioおよび/またはOxford Nanoporeシーケンスによって検証されています。

シークエンス結果

Nanobind Tissue Big DNA Kitを使用して抽出されたHMW DNAのシーケンス検証は、PacBio®Sequel®システムを使用して実行されました（図4）。

ワークフロー

プロトコル選択ガイド

Nanobind Tissue kitの通常プロトコルでは、破砕方法の違いにより2種のプロトコルをご用意しております。
それぞれの最適なプロトコルを下記リンクからご参照ください。

  • サンプル破砕機 「TissueRupotor（Qiagen社）」による破砕
  • ダウンス型ホモジナイザーを用いた破砕

また、特定のサンプルタイプに特化した専用プロトコルのご用意もございます。詳細は下記一覧をご参照ください。

サンプルタイプ インプット量 プロトコル 目的 キット
動物組織
(Tissue Ruptor)		 25 mg Procedure & checklist Extracting HMW DNA from animal tissue using TissueRuptor 一般的なHMW DNA抽出

Nanobind
Tissue
Kit
動物組織
(Dounce homogenizer)		 25 mg Procedure & checklist Extracting HMW DNA from standard Dounce homogenizer tissue using Nanobind® kits
特定のサンプルタイプで確立されたプロトコル
cryoPREP 組織
ホモジナイゼーション		 25 mg Procedure & checklist Homogenizing tissue using cryoPREP Covaris cryoPREP 装置を使用した組織破砕の例

Nanobind
Tissue
Kit
アメフラシ 25 mg Procedure & checklist Extracting HMW DNA from Aplysia tissue using Nanobind® kits アメフラシ組織からの
HMW DNA抽出例
カタツムリ 100 mg Procedure & checklist Extracting HMW DNA from black mystery snail tissue using Nanobind® kits カタツムリ組織からの
HMW DNA抽出の例
カニ 100 mg Procedure & checklist Extracting HMW DNA from crab muscle using Nanobind® kits カニの筋肉からの
HMW DNA抽出例
各種魚組織 25 mg Procedure & checklist Selecting fish tissue type for sequencing 各種魚組織の
HMW DNA 比較データ
魚の精巣 25 mg Procedure & checklist Extracting HMW DNA from tilapia testis using Nanobind® kits 魚の精巣からの
HMW DNA抽出例
魚の骨格筋 50 mg Procedure & checklist Extracting HMW DNA from fish skeletal muscle using Nanobind® kits 魚の骨格筋からの
HMW DNA抽出例
ヒト乳房 20 mg Procedure & checklist Extracting HMW DNA from human breast tissue using Nanobind® kits 線維性ヒト乳房からの
HMW DNA抽出例
哺乳類の脳 22 mg Procedure & checklist Extracting HMW DNA from mammalian brain tissue using Nanobind® kits 哺乳類の脳からの
HMW DNA抽出例
哺乳類の肝臓 23 mg Procedure & checklist Extracting HMW from mammalian liver using Nanobind® kits 哺乳類の肝臓からの
HMW DNA抽出例
哺乳類の脾臓 19 mg Procedure & checklist Extracting HMW DNA from mammalian spleen using Nanobind® kits 哺乳類の脾臓からの
HMW DNA抽出例

関連製品

仕様

キット構成内容
製品名 Nanobind Tissue Big DNA Kit
入数 24回分/1キット

構成内容


 Nanobind Disks
Buffer CT
Proteinase K
RNase A
Buffer SB
Buffer CLE3
Buffer BL3
Buffer CW1 Concentrate
Buffer CW2 Concentrate
Buffer EB
 

デモ・サンプル・その他お問い合わせはお気軽に

製品によってはサンプルのご用意が無い場合もございます。予めご了承ください。

お問い合わせ

技術資料

SDS

FAQ

製品仕様

Nanobind 高分子ゲノムDNA抽出キット（組織用）は、どのようなサンプルで使用できますか？

Nanobind 高分子ゲノムDNA抽出キット（組織用）は、哺乳類、魚、甲殻類、鳥、昆虫など、さまざまな動物サンプルで使用可能です。

製品仕様

HMW DNA（高分子量DNA）とは何ですか？

HMW DNA（高分子量DNA）は、50〜300 kbのサイズ範囲の大きなDNAです。
これは、PacBioまたはONTのロングリードシーケンスに最適なサイズです。
すべてのNanobindキットは、このサイズ範囲のHMW DNAを抽出するように設計されており、25〜50 kb未満の小さなDNAはほとんど精製されません。

製品仕様

UHMW DNA（超高分子量DNA）とは何ですか？

UMHW DNA（超高分子量DNA）、50 kb-1 + Mbのサイズ範囲の非常に大きなDNAです。
これは、DNAマッピング、およびメガベース長のロングリードまたは超ロングリード（> 150 kb）N50の生成に適しています。
UMHW DNAは、1〜2時間で精製できます。

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この製品に関するFAQ一覧

レビュー

5 1件のレビュー

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5.0

2021年02月05日

他のDNA抽出キットだと本来抽出したい高分子DNAだけでなく分解してしまったDNAも混ざってしまっていましたが、このキットを使用すると高分子のもののみ抽出することができました。またそれにより他の試薬などを用いて高分子DNAのみに精製する手間もかからないため時間も短縮できとてもよかったです。

使用していた組織が30年ほど前のもので分解したDNAや夾雑物が多かったにもかかわらず高分子のみ抽出することが可能でした。
手順もわかりやすいため簡単に取り扱えました。
キット内のボトルにエタノールを加えるものがあるが、チェックボックスが小さく記載文も小さいので大きく印字して頂けるとよかったです。
蓋にもチェックが書けるととても使いやすくなります。
また同じようなマグネットラックを使用したもののうまくディスクがキャプチャされず難しかったです。

（日本ジェネティクスより）
この度は貴重なご意見をお聞かせいただき、誠にありがとうございます。
今後の製品改良・改善の参考とさせて頂きたいと思います。
またお気づきの点がございましたら、いつでもご意見をお寄せください。
この度は誠に有難うございました。
2021年2月5日

東京大学 農学部 吉武和敏 様

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