NanoBind 高分子ゲノムDNA抽出キット(細胞・全血・バクテリア用)

NanoBind 高分子ゲノムDNA抽出キット(細胞・全血・バクテリア用)

(Nanobind CBB Big DNA Kit (Cells, Bacteria, Blood))

Circulomics

製品概要

ハイクオリティな高分子ゲノムDNAを最適に抽出・精製を可能にするキット

NanoBindとは?

NanoBindは、Circulomics社が独自に開発した高密度シリカのナノ構造を利用したテクノロジーです(図1)。
NanoBindテクノロジーを磁気ディスクと組み合わせることにより、従来の磁気ビーズやシリカ製スピンカラムを使用するキットでは実現できなかった、ハイクオリティな高分子(~300+kb)または超高分子(~1+Mb)ゲノムDNAを抽出・精製することが可能となり、第3世代シークエンス時のN50値を大幅に向上させることができます。


図1. Nanobindによる高密度シリカ表面構造のSEM画像。

Nanobind CBB Big DNA Kit (Cells, Bacteria, Blood)の特長

  • 高分子ゲノムDNA抽出キット(細胞・全血・バクテリア用)
  • ハイクオリティな高分子(50 kb – 300+ kb)または超高分子(~1+Mb)ゲノムDNAを抽出・精製
  • 第3世代ロングリードシークエンス時のN50値を大幅に向上
  • 高分子 (~300+kb) または超高分子 (~1+Mb) DNAの抽出に応じて、2種類のプロトコールが選択可能
  • 自動化に対応
  • 本製品は細胞・全血・バクテリア用です。
    (組織、植物に使用可能なラインナップもございます。詳しくは関連製品のご案内をご覧ください。)

期待される収量

HMW(50 kb – 300+ kb)およびUHMW(50 kb – 1+ Mb)DNA抽出用のプロトコルを使用した場合(図2)。
抽出されたDNAは、PacBio RSII / Sequel、Oxford Nanopore MinION / GridION / PromethION、Bionano Genomics Irys / Saphyr、10X Genomics Chromiumなど、さまざまなゲノミクスプラットフォームで使用されています。

図2.Nanobindを使用して抽出したHMWおよびUHMW DNAのパルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)の比較。HMWプロトコルは通常、50〜300+ kbのDNAをもたらします(レーン左)。 UHMWプロトコルは、長さが5.7 Mbを超えるメガベースDNAを取得できます(レーン右)。

サンプルと期待収量

HMWゲノムDNAの収量は、処理されるサンプルによって異なります。
次の表に、検証済みのサンプルタイプの推奨入力範囲と予想収量を示します(図3)。
各サンプルは、長い読み取りシーケンスによって検証されています。

シークエンス結果

Nanobind CBB Big DNA Kitを使用していくつかのサンプルタイプから抽出されたHMW DNAのシーケンス検証は、PacBio®Sequel®ロングリードシーケンスプラットフォームを使用して実行されました(図4)。

ワークフロー

関連製品

NanoBind 高分子ゲノムDNA抽出キット(対象サンプル:組織用)
NanoBind 高分子ゲノムDNA抽出キット(対象サンプル:植物)

仕様

キット構成内容
CatNo. NB-900-001-01
製品名 Nanobind CBB Big DNA Kit(Cells, Bacteria, Blood)
入数 20回分/1キット
構成内容 プロテイナーゼK
RNase A
CLE3消化バッファー
BL3溶解/結合バッファー
CW1洗浄バッファー
CW2洗浄バッファー
EB溶出バッファー
20 x MagNanobindディスク
 

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CatNo. メーカーコード・旧型番 概要 単位 価格 在庫 EC価格
NB-900-001-01 Nanobind CBB Big DNA Kit (Cells, Bacteria, Blood) 20回用 在庫わずか 受注発注品 返品不可

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