- お客様事例
効果的なstranded RNA-Seq用ライブラリー調製キット 選定評価試験 ～ Embryonic stem cell（ES cell）およびPrimitive endoderm cell（PrE cell）を用いたrRNA depletion RNA-Seq ～
理化学研究所情報基盤センター バイオインフォマティクス研究開発ユニット
梅田 茉奈様、林 哲太郎様、笹川 洋平様、二階堂 愛 様
お客様のコメント
rRNA-depletion 以降からの Library 調整のステップがより簡素化・高速化されているため、実務作業として楽 に感じられました。従来の製品より、より安定して RNA-seq を運用できると期待されます。
概要
【Cat.No. KK8560、KK8561】
KAPA RNA HyperPrep Kitシリーズは、従来のstranded RNA-Seqライブラリー調製キットで実施される複数の酵素反応ステップを統合し、ワークフローをstreamline化した新しいキットです。
このように、ワークフローのstreamline化で「操作の煩雑性」や「精製によるサンプルロスのリスク」を低減させることにより、これまでよりも短時間の操作で、再現性高く、ストランド特異的な発現解析が可能となります。
今回は、効果的なstranded RNA-Seq用ライブラリー調製キットの選定を目的として、
KAPA RNA HyperPrep Kit with RiboEraseを用い、マウスEmbryonic stem cell（ES cell）と、そこから分化させたPrimitive endoderm cell（PrE cell）についてそれぞれrRNA depletion（rRNA除去）RNA-Seqを行い、評価した事例についてご紹介します。
