- お客様事例
KAPA HyperPlus Kitを用いた植物サクラソウの全ゲノムシーケンス
株式会社ファスマック
勝又哲史 様
お客様のコメント
KAPA HyperPlus Kitはライブラリ作成効率が非常に良く、わずかなDNA量であっても全ゲノムシーケンスが 可能であるため、 近縁種間で転用可能なSSRマーカーを迅速かつ大量に開発する上で非常に有効な手段であることを実感しま した。
概要
【Cat.No. KK8510、KK8512、KK8514】
植物において、SSR（simple sequence Repeat）マーカーを用いた解析手法は、品種の識別や同定において非常に有効である。
近年は、次世代シーケンサーの普及により、これまでに遺伝子配列が決定されていない植物種においても、より幅広く効率的にSSRマーカーを探索することが可能となってきている。
これにより、例えば絶滅が危惧されるような希少な植物種の保護やその環境保全を目的としたSSRマーカーの探索も可能となる。
今回、サクラソウ属5種から抽出したゲノムDNAからKAPA HyperPlus Kitを用いてライブラリーを調製し、MiSeqで全ゲノムシーケンスを実施することで、これらの識別を可能とするSSRマーカーの探索を試みた。
