- お客様事例
アジレント・テクノロジー社SureSelect XTターゲットエンリッチメントシステムを用いた、微量FFPEゲノムDNA（50ng）からのエクソームシークエンシング
理化学研究所 統合生命医科学研究センター ゲノムシーケンス解析研究チーム
中川 英刀様、前嶋 和紘 様
お客様のコメント
臨床データの豊富さや希少疾患(腫瘍)への解析のため、FFPEサンプルのNGS解析が、今後、求められています。
概要
【Cat.No. KK8500、KK8502】
FFPE（formalin-fixed paraffin embedded：ホルマリン固定パラフィン包埋）組織サンプルから抽出したゲノム DNA の次世代シークエンス解析は、特に臨床研究分野において、大変重要なアプリケーションのひとつとして期待されています。
一般的に、FFPE 由来のゲノム DNA を用いた場合、シークエンスに必要なライブラリー量が得られ難いため、シークエンスデータの 解析において、結果的に duplication rate が高く、十分な coverage や
sequence depth が得られないことが問題となります。
ここでは、SureSelect XT ターゲットエンリッチメントシステム（アジレント・テクノロジー株式会社）を用いた FFPE 組織サンプルの WES （Whole-exome sequencing) 解析において、
KAPA Hyper Prep Kit と組み合わせることで、非常に期待される改善結果が得られた事例をご紹介いたします。
