NanoBind 高分子ゲノムDNA抽出キット(植物)

NanoBind 高分子ゲノムDNA抽出キット(植物)

(Nanobind Plant Nuclei Big DNA Kit)

Circulomics

製品概要

ハイクオリティな高分子ゲノムDNAを最適に抽出・精製を可能にするキット

NanoBindとは?

NanoBindは、Circulomics社が独自に開発した高密度シリカのナノ構造を利用したテクノロジーです(図1)。
NanoBindテクノロジーを磁気ディスクと組み合わせることにより、従来の磁気ビーズやシリカ製スピンカラムを使用するキットでは実現できなかった、ハイクオリティな高分子(~300+kb)または超高分子(~1+Mb)ゲノムDNAを抽出・精製することが可能となり、第3世代シークエンス時のN50値を大幅に向上させることができます。

図1. Nanobindによる高密度シリカ表面構造のSEM画像。

Nanobind Tissue Big DNA Kitの特長

  • 高分子ゲノムDNA抽出キット(植物用)
  • ハイクオリティな高分子(50 kb – 300+ kb) ゲノムDNAを抽出・精製
  • 第3世代ロングリードシークエンス時のN50値を大幅に向上
  • 本製品は植物用です。
    (細胞・全血・バクテリア、組織に使用可能なラインナップもございます。詳しくは関連製品のご案内をご覧ください。)

期待される収量

HMW(50 kb – 300+ kb)DNAの抽出用のプロトコルが提供されています(図2)。
抽出されたDNAは、PacBio RSII / Sequelを含む様々なゲノミクスプラットフォームで使用されています。

図2.ナノバインドを使用して沿岸のレッドウッド核から抽出されたHMW DNAを示すパルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)植物核Big DNA抽出キット。ゲル画像は、標準(レーン左)とワイドボアピペットチップ(レーン右)で処理されたHMW DNAを示しています。

サンプルと期待収量

HMWゲノムDNAの収量は、処理されるサンプルによって異なります。
次の表に、検証済みのサンプルタイプの推奨入力範囲と予想収量を示します(図3)。
各サンプルは、ロングリードシーケンスにより検証されています。

シークエンス結果

Nanobind Plant Nuclei Big DNA Kitを使用していくつかのサンプルタイプから抽出されたHMW DNAのシーケンス検証は、PacBio®Sequel®ロングリードシーケンスプラットフォームを使用して実行されました(図4)。

ワークフロー

関連製品

NanoBind 高分子ゲノムDNA抽出キット(対象サンプル:細胞・全血・バクテリア)
NanoBind 高分子ゲノムDNA抽出キット(対象サンプル:組織用)

仕様

キット構成内容
CatNo. NB-900-801-01
製品名 Nanobind Plant Nuclei Big DNA Kit
入数 20回分/1キット
構成内容


プロテイナーゼK
RNase A
バッファーCT
バッファーSB
CLE3消化バッファー
BL3溶解/結合バッファー
CW1洗浄バッファー
CW2洗浄バッファー
EB溶出バッファー
20 x MagNanobindディスク
 

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CatNo. メーカーコード・旧型番 概要 単位 価格 在庫 EC価格
NB-900-801-01 Nanobind Plant Nuclei Big DNA Kit 20回用 在庫わずか 受注発注品 返品不可

EC going 及び BPM購入システムとは?
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