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納期/出荷日について

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CatNo. メーカーコード・旧型番 概要 単位 価格 在庫 EC価格
C19157 FormaPureRNA(50preps) 50 Preps お問い合わせください 受注発注品 返品不可
C19158 FormaPureRNA(96preps) 96 Preps お問い合わせください 受注発注品 返品不可
マグネットアクセサリ
A29182 SPRIstand 6 Position Tube Magnet (1.5/2mLチューブ用) 1個 在庫わずか
A32782 SPRIPlate 96 Ring Super マグネットプレート(96ウエルプレート用) 1個 在庫わずか

EC going 及び BPM購入システムとは?
EC going FAQ

製品概要

FFPEサンプルから高収量・高品質なRNAを抽出

FFPE(Formalin-Fixed, Paraffin - Embedded:ホルマリン固定パラフィン包埋)組織からの高品質なRNA抽出は、癌研究分野の解析アプリケーションにおいて重要性を増しています。FFPEサンプルに特有なホルマリンの残留やRNAに架橋構造が生じることにより、ダウンストリームで使用可能なRNAの抽出は困難ですが、FormaPure RNAは次世代シーケンス解析で良好な結果が得られる程度に高収量かつ高品質なRNAを抽出・精製することが可能です。

FormaPure RNAはキシレンなどの有機溶媒を使用せず、ミネラルオイルによる油層/水相分離により脱パラフィンを行うことができ、抽出操作も簡単です。また96ウェルプレートフォーマットで、脱クロスリンクから精製までの処理が可能なため、簡単にスループットを向上させることができます。

特長

  • 10 μm FFPE切片3枚までのRNA抽出に対応
  • 次世代シーケンスに使用可能なRNA収量・精製度
  • キシレン不使用で、ラボの安全性に寄与

概要

さまざまな組織の長期保存FFPEサンプルからRNA抽出
FormaPure RNAはさまざまな組織の長期保存FFPEサンプルからでも高収率でRNAを抽出精製できます。各組織(ヒト乳がん組織、ヒト大腸がん組織、ヒト肝臓がん組織、ヒト肺がん組織)のFFPEサンプルから抽出したRNA量を測定しました(表1)。

【表1】さまざまな保存年数およびがん組織由来のFFPEサンプル各10 μm 切片1枚あたりのRNA収量(ng)
RNA定量はRiboGreen蛍光測定により行った。



各組織のFFPEサンプルから断片長が大きい高品質なRNAを抽出
FormaPure RNAはさまざまな組織のFFPEサンプルから、切断の少なく断片長が大きいRNAを抽出精製できます。各組織(ヒト乳がん組織、ヒト大腸がん組織、ヒト肝臓がん組織、ヒト肺がん組織)のFFPEサンプルから抽出したRNAのフラグメントサイズを、
FormaPure RNAと他社製品で比較したところ、FormaPure RNAのほうが200 nt以上の割合が大きく、断片化の少ない高品質なRNAが抽出されました(図1)。

【図1】FormaPure RNAによる、分解の少ないRNAの抽出
4種類のFFPEがん組織から抽出したRNAの断片サイズを、Fragment Analyzer (Advanced Analytical)で解析しました。
FormaPure RNAで抽出したRNAは青色、他社製品で抽出したRNAはオレンジ色。DV200の値は、200 ntを超えるRNA量のパーセンテージを示します。


大量処理も可能な効率の良いプロセス
FormaPure RNAは磁性ビーズを用いており、96ウェルベースでの大量処理にも適しています。
ベックマン・コールター社の自動分注機Biomekシリーズによる自動化も可能です。Biomek i-Seriesを用いれば、96サンプルからのRNA抽出を、脱パラフィンを含めたハンズオン30分の、約5.5時間で処理可能です。

 

実験ステップ


1: Mineral Oilを加え加熱し、パラフィンを溶解
2: Lysis、Proteinase Kを加え組織消化
3: Bindを加え、核酸をSPRI磁性ビーズに結合
4: エタノールで洗浄
5: DNase I 処理
6: Re-Bindを加え、RNAをSPRI磁性ビーズに再結合
7: エタノールで洗浄
8: 溶出液を加える
9: 精製RNAを回収

アプリケーション

  • 次世代シーケンシング (RNA-Seq 解析)
  • 通常のエンドポイント RT-PCR
  • qRT-PCR

関連製品

仕様

内容構成

  • Mineral Oil (MO)
  • Lysis (LBA)
  • Bind (BBA)
  • Re-Bind (RBA)

保存方法:室温保存

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