ライブラリー増幅後に、3.0% ゲルカセット、Internal Standard Q3（マーカー）を使用して分画および回収を試みましたが、マーカーが検出されませんでした。 どのような原因が考えられますか？

泳動前に精製が行われていることをご確認ください。 弊社の経験として、ライブラリー増幅後に未精製のまま泳動をしたことが原因でInternal Standard（マーカー）の検出ができなかった事例がございます。 この場合、泳動時にプライマーやアダプターのダイマーがInternal Standard（マーカー）と干渉してしまい、マーカーのピーク検出を妨げたと考えられます。