OUTLET MARKET FormaPure DNA Kit
研究用消耗品・研究用試薬・研究機器のアウトレット

DETAILS商品詳細

FormaPure DNA Kit

ベックマンコールター(アジェンコート)

FormaPure DNA Kit

正規型番:B89230アウトレット型番:OL-BC-3709
入数:50preps

  • ワケあり
説明
期限切れ間近 or 直後の製品です(使用期限:2019年9月)。
2019年12月末まで掲載いたします。

正規品の情報はこちらをご覧ください。
リンク先のページが表示されない場合や、詳しい商品情報をお求めの場合はお問い合わせ下さい。

商品仕様

FFPEサンプルから高収量・高精製度でDNAを抽出
FFPE(Formalin-Fixed, Paraffin - Embedded:ホルマリン固定パラフィン包埋)組織からの高品質なDNA抽出は、癌研究分野の解析アプリケーションにおいて重要性を増しています。
FFPEサンプルに特有なホルマリンの残留やDNAに架橋構造が生じることにより、ダウンストリームで使用可能なDNAの抽出は困難ですが、FormaPure DNAは次世代シーケンス解析で良好な結果が得られる程度に高収量かつ高品質なDNAを抽出・精製することが可能です。

FormaPure DNAはキシレンなどの有機溶媒を使用せず、ミネラルオイルによる油層/水相分離により脱パラフィンを行うことができ、抽出操作も簡単です。
また96ウェルプレートフォーマットで、脱クロスリンクから精製までの処理が可能なため、簡単にスループットを向上させることができます。

特長

  • 10 μm FFPE切片3枚までのDNA抽出に対応
  • 次世代シーケンスに使用可能なDNA収量・精製度
  • キシレン不使用で、ラボの安全性に寄与

概要

さまざまな組織のFFPEサンプルから高収量のDNA
FormaPure DNAはさまざまな組織のFFPEサンプルからでも高収率で核酸を抽出精製できます。
各組織(Horizon標準組織、ヒト乳がん組織、ヒト大腸がん組織、ヒト肝臓がん組織、ヒト肺がん組織)のFFPEサンプルから抽出した核酸量を測定し、他社製品(A)と比較しても良好な収率を示しました(図1)。


【図1】各10 μm 切片あたりのDNA収量(ng)をFormaPure DNA(FP DNA)と他社製品(A)で比較
様々ながん組織由来のFFPEサンプルおよびHorizon Discovery- HD200 FFPE標準サンプルを用いた。
DNA収量はQuant-iTアッセイにより行った(n=8)。




さまざまな組織のFFPEサンプルから高品質のDNA

FormaPure DNAは高い収量だけではなく、高い精製度でDNAを回収することが可能です。
抽出されたDNAは、吸光度比は1.6~1.7(260/280nm)および1.3~2.0(260/230nm)で高い精製度であることが示されました(図2)。


【図2】10 μm 切片からFormaPure DNAで抽出したDNAの260/280および260/230吸光度比
様々ながん組織由来のFFPEサンプルおよびHorizon Discovery- HD200 FFPE標準サンプルを用いた(n=8)。



次世代シーケンスに求められるDNA品質にも適合
FormaPure DNAは、FFPEサンプルからのDNA抽出時に抽出バイアスがかかりづらい特徴があります。

FormaPure DNAで抽出したDNAをサンプルとして次世代シーケンス解析を行った結果、低頻度バリアント(変異)も安定して検出できました(表1)。

FormaPure DNAは、次世代シーケンスのサンプル調製に適していることが分かります。



【表1】FormaPure DNAで抽出したDNAで次世代シーケンスを行った際の、低頻度バリアントの検出例



大量処理も可能な効率の良いプロセス
FormaPure DNAは磁性ビーズを用いており、96ウェルベースでの大量処理にも適しています。

ベックマン・コールター社の自動分注機Biomekシリーズによる自動化も可能です。
Biomek i-Seriesを用いれば、96サンプルからのDNA抽出を、脱パラフィンを含めたハンズオン30分の、約5.75時間で処理可能です。




実験ステップ


1: Mineral Oilを加え加熱し、パラフィンを溶解
2: Lysis、Proteinase Kを加え組織消化
3: 加熱し脱クロスリンク
4: RNase A処理
5: Bindを加え、DNAをSPRI磁性ビーズに結合
6: エタノールで洗浄
7: Washで洗浄
8: エタノールで洗浄
9: 溶出

アプリケーション

  • 次世代シーケンシング (アンプリコン解析、ターゲット・キャプチャー解析、エキソーム解析、全ゲノム解析)
  • 通常のエンドポイント PCR
  • qPCR

関連製品



内容構成

  • Mineral Oil (MO)
  • Lysis (LBA)
  • Bind (BBA)
  • Wash (WBA)
  • RNase A
  • Proteinase K

保存方法:室温保存

通常価格
¥ 40,000

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