PCRを行う際、DNA Saveペーパー溶液に入れたまま、紙は取り除かずに行う、ダイレクトPCRは可能なのでしょうか？

ダイレクトPCRは実施可能です。

ただし、サンプルの状態によっては、阻害耐性の強いPCR酵素を選択していただく必要がございます。