400 kbくらいのサイズを分離させるのに泳動時間はどのくらいかかりますか？

ご使用になるサンプルや、どの程度バンドを分離させたいか等によって泳動時間は異なりますので、具体的な時間をお答えするのは難しいです。

Pippin Pulseクイックガイド 6ページ目に、5-430 kb プログラムを用いて16時間泳動した結果がありますので、まずは、こちらの時間を目安としてご確認ください。

Pippin Pulseクイックガイドは＞＞こちら