マウス糞便を採取する場合の推奨方法を教えてください。

マウスから排泄された糞便を直接採取し（肛門から直接採取など）、1匹ごとに3粒程度をエッペンチューブに保管してください。
床敷などに落ちている糞便は菌叢が変わっている可能性がありますので、正確な測定ができませんのでご注意ください。