16Sのオーダーでも正確な菌種同定が可能なのでしょうか？

16S解析は、菌種特異的な16S領域の配列に基づいた菌種分類を行う手法です。
その結果、菌種、菌種数、菌種組成、細菌叢構造解析が行えます。
メタゲノム（ショットガン）解析は、菌叢丸ごとをユニークな菌叢ゲノム配列を解析する手法です。
その結果、機能、代謝プロファイル解析等が行えます。