Q
プラットフォームとしてMiSeqを用い、75サイクルのランを予定しています。 本キットでは、Fragmentationの温度、時間によりライブラリーのインサートサイズを変更できるようですが、最適なサイズを教えてください。
もしもペアエンドで実施されるようでしたら、75x2=150bpとなりますので、リードの重複を避けるにはインサートサイズは150bp以上になるように設定いただいたほうが良いかと存じます。
この場合、94℃ 6minで実施いただければ、200-300bpに断片化されますので、ご検討ください。
(なお、元のRNAの状態により、最適化が必要な場合がございますので、ご了承ください。)