生物種が異なるサンプルにて、バイオインフォマティクス解析（BI解析）で比較することは可能でしょうか？

生物種が異なるサンプルの場合、対応は難しくなります。

BI解析サービスは、同一のリファレンス配列を用いてマッピング作業を実施した上で、発現量解析などを行います。

しかし、同一のリファレンス配列を用いるため、一方の生物種ではリファレンス配列が適合せず、マッピング率が非常に低くなることが予想されます。

マッピング率が低い場合は、BI解析に進行できない、またはBI解析の結果の信頼性が低くなります。

対して、サンプル毎にリファレンス配列を設定してマッピングを行うことは可能ですが、この場合はサンプル間の比較解析が出来なくなります。