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(非ストランド特異的)mRNA-Seqと、ストランド特異的RNA-Seqの違いについて教えてください。

(非ストランド特異的)mRNA seqの場合、DNA鎖のセンス鎖とアンチセンス鎖、どちらからの発現かを見分けることができません。

対して、ストランド特異的RNA seqの場合、センス鎖とアンチセンス鎖のどちらの DNA鎖から転写されるかを判別することができます。

*ストランド特異的RNA seqは、RNA から合成された cDNA2 本鎖)の 第 1 鎖のみ からライブラリーが調製されることで、元の RNA の方向性を保つことができます。

*第2 cDNAの合成時にウラシルが取り込まれることで、 第2鎖は増幅が阻止されます。

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