- お客様事例
無脊椎動物由来トータルRNAからの de novo RNA-seq
理化学研究所情報基盤センター バイオインフォマティクス研究開発ユニット
笹川 洋平 様
お客様のコメント
【Cat.No. KK8420】
安定した目的サイズ長と十分な量の収量のライブラリーDNAを得ることが出来た。トランスクリプトの方向性を考慮したde novo assemblyを行い十分な性能を得ることが出来た。
概要
KAPA BIOSYSTEMS社KAPA Stranded mRNA-Seq Kit（KK8420）を用い、無脊椎動物由来のトータルRNAからのde novo RNA-seqを 試みた。
（1）断片化において、想定どおりのライブラリーサイズ分布が得られるか
（2）極力少ないサイクル数で、期待どおりのライブラリー量が得られるか
（3）シーケンス結果において、十分なデータ量を得られるか
について検証したので、それについて報告する。
