自動DNA断片ゲル抽出装置

ブルーピッピン(Blue Pippin)

機器 >> 電気泳動関連機器 >> 自動DNA断片ゲル抽出装置

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概要 お気軽にお問い合わせください

NEW! Blue Pippin
NEW! Blue Pippin

特長

次世代シーケンサー用DNAフラグメント調製に最適!

●煩雑なマニュアルでのゲル抽出操作が不要となり、実作業時間の短縮を実現します。
●より狭い分布のDNA断片の抽出が可能です。
●低分子DNAのコンタミを減少させることで、無駄なリードや不明瞭な判定を減らし、シークエンス効率がアップします。
●ゲルカセットの各レーンが独立しているため、泳動中の拡散によるサンプル間のコンタミリスクが発生しません。
●メーカー保証期間: 2年間
 

Pippinシリーズが有用な次世代シークエンスアプリケーション

●ペアエンドシークエンスライブラリー作製
●ChiP-Seqライブラリー作製
●miRNAライブラリー作製
●メイトペアシークエンスライブラリー作製

ゲルカセット各種

ゲルカセット

目的のサイズレンジ
3.0% アガロース 90bp - 250bp
2.0% アガロース 100bp - 600bp
1.5% アガロース 250bp - 1.5kb
0.75% アガロース 2.0kb - 27kb


▶▶ BluePippin専用ゲルカセット・DNAコントロールキット・試薬キット

製品を使用されたお客様の声

『miRNA Seqのライブラリー調製では、アダプターが付与された140bp付近のライブラリー産物のみを回収する必要があります。しかし、近接するサイズに未反応のアダプターやアダプターダイマーなど複数の産物が混在するため、目的サイズのみの単離・回収が非常に難しい工程でした。
私が使用しているmiRNA Seqキットでは、BluePippinを用いた単離・回収が推奨されていたこともあってデモ機をお借りしてサイズセレクションを行ってみました。
その結果、目的のサイズ域がきれいに精製され、量も確保できまして、無事にシーケンスができました。miRNA sequencingを行う際にはBluePippinが必須になるのではと考えております。』
(国内製薬企業研究者様より)

※その他、国内実績多数ございます。「アプリケーションノート」タブよりご覧ください。

参考文献


Naomi Park* et al,
An improved approach to mate-paired library preparation for Illumina sequencing,
Methods in Next Generation Sequencing. Volume 1, Pages 10–20, ISSN (Online) 2084-7173, DOI: 10.2478/mngs-2013-0001, July 2013

*Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, UK.
「Illumina社次世代シーケンシングにおけるメイトペア・ライブラリー調製法の改良」

この論文のリンク先はこちらになります。このページから直接ダウンロードできます。


Modified Mate-Pair Protocol Lowers Cost, Boosts Library Yield
著者である理化学研究所 ライフサイエンス技術基盤研究センター(CLST)分子配列比較解析ユニット
工樂 樹洋様よりコメントを頂戴しました。
「コストがかかり不安の多いメイトペアライブラリ作成の負担を軽減するプロトコールを提案。
サイズセレクションにはBluePippinを使用。」

【関連製品】(Sage Scienceのウェブサイトへリンクします)
●本製品用アガロースゲルカセット の詳細はこちら
●回収DNAフラグメントサイズ 90bp - 1.5kb の Pippin Prep の詳細はこちら

【関連情報】(Sage Scienceのウェブサイトへリンクします)
●Pippin family のアプリケーションとプロトコルはこちら
●PacBioユーザー様向け情報はこちら

仕様 お気軽にお問い合わせください

仕様 Blue Pippin Pippin Prep
泳動方式 定電圧電気泳動
パルスフィールド電気泳動
定電圧電気泳動
泳動時間(目安)
(目的サイズによって異なります)
30分~8時間 50分~2時間
最大サンプル添加量 10μg(断片化gDNA)、
2μg(制限酵素消化DNA断片/PCR産物)
10μg(断片化gDNA)、
4μg(制限酵素消化DNA断片/PCR産物)
回収率(目安)
~80%
回収精度(目安)
±5-10%
(0.75%ゲルカセットは、サンプル量により変動します)
本体仕様 Blue Pippin Pippin Prep
使用電源 100-240V(Constant) 2.5A / 50-60Hz
蛍光検出 励起波長:470nm 励起波長:535nm
検出波長:525nm 検出波長:640nm
寸法 W 280 x D 530 x H 180mm
重量 7kg

製品カタログお気軽にお問い合わせください

2018年予算申請用 機器カタログ/日本語
公開日:2017年08月31日
ファイル形式:pdf
ファイルサイズ:2 MB
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Sage Science_自動DNA断片ゲル抽出システム/日本語
公開日:2017年05月01日
ファイル形式:pdf
ファイルサイズ:2.44 MB
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Pippin Family/英語
公開日:2015年04月30日
ファイル形式:pdf
ファイルサイズ:0.81 MB
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取扱説明書お気軽にお問い合わせください

BluePippinクイックガイド/日本語
公開日:2016年05月02日
ファイル形式:zip
ファイルサイズ:6.69 MB
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Blue Pippin_v6.13-CD15/英語
公開日:2015年07月27日
ファイル形式:pdf
ファイルサイズ:2.93 MB
ダウンロード
BluePippin_PacBio_SMRTbellライブラリー向け取扱説明書vs3/英語
公開日:2013年09月20日
ファイル形式:pdf
ファイルサイズ:1.43 MB
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技術資料お気軽にお問い合わせください

アップデータ_BluePippin_v6.30-CD26
公開日:2017年05月16日
ファイル形式:zip
ファイルサイズ:2.55 MB
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ソフトウェアアップグレード資料_v.6.20/英語
公開日:2015年08月05日
ファイル形式:pdf
ファイルサイズ:0.39 MB
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機能拡張データPacBio-SMRTbell_BluePippin_v6.20
公開日:2015年07月28日
ファイル形式:zip
ファイルサイズ:2.47 MB
ダウンロード
BluePippinとSageELFの回収率比較/日本語
公開日:2015年07月09日
ファイル形式:pdf
ファイルサイズ:1.85 MB
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インターナルマーカー配列情報/英語
公開日:2015年02月26日
ファイル形式:pdf
ファイルサイズ:0.25 MB
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NGS現場の会_第3回研究会_発表ポスター(OIST-Pippin)
公開日:2013年09月20日
ファイル形式:pdf
ファイルサイズ:1.8 MB
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ソフトウェアアップグレード手順書_BluePippin
公開日:2013年08月20日
ファイル形式:pdf
ファイルサイズ:0.39 MB
ダウンロード
NGS現場の会_第2回研究会_発表ポスター(国府台HP)
公開日:2013年01月18日
ファイル形式:pdf
ファイルサイズ:1.16 MB
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アプリノートお気軽にお問い合わせください

PacBio RS II・P5-C3ケミストリーでの長鎖ライブラリー調製)/日本語
公開日:2014年07月23日
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ファイルサイズ:1.04 MB
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Nextera Mate Pair ライブラリー調製における長鎖(8kb) サイズセレクション/日本語
公開日:2014年07月01日
ファイル形式:pdf
ファイルサイズ:1.6 MB
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BluePippinを用いた8kb長鎖DNA断片抽出の検討/日本語
公開日:2014年02月06日
ファイル形式:pdf
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NGSライブラリーDNA断片の再現性高いサイズセレクション/日本語
公開日:2012年05月15日
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NGSライブラリーRNA断片の再現性高いサイズセレクション/日本語
公開日:2012年02月25日
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高分子DNA除去によるリード数の向上/日本語
公開日:2012年01月04日
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3kbおよび5kb長鎖NGSライブラリーのサイズセレクション/日本語
公開日:2012年01月04日
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NGSライブラリーサイズセレクション比較データ/日本語
公開日:2011年12月27日
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断片化ゲノムDNAのサイズセレクションにおける回収量/日本語
公開日:2011年08月02日
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過剰未反応アダプターによるサチュレーション対策 / 日本語
公開日:2011年08月02日
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NGSライブラリーサイズ分布の微量解析/日本語
公開日:2011年06月02日
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溶出レンジを拡大させるための溶出モジュール閉鎖方法 / 英語
公開日:2011年06月02日
ファイル形式:pdf
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Illuminaアダプターライゲーション後の迅速クリーンアップ/英語
公開日:2011年05月16日
ファイル形式:pdf
ファイルサイズ:0.38 MB
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FAQお気軽にお問い合わせください

ライブラリー増幅後に、3.0% ゲルカセット、Internal Standard Q3(マーカー)を使用して分画および回収を試みましたが、マーカーが検出されませんでした。
どのような原因が考えられますか?
泳動前に精製が行われていることをご確認ください。
弊社の経験として、ライブラリー増幅後に未精製のまま泳動をしたことが原因でInternal Standard(マーカー)の検出ができなかった事例がございます。
この場合、泳動時にプライマーやアダプターのダイマーがInternal Standard(マーカー)と干渉してしまい、マーカーのピーク検出を妨げたと考えられます。

ムービーお気軽にお問い合わせください

カセットの前準備(ミドリグリーンを使用したバンド検出)



PippinPrep/BluePippinゲルカセット(サイズセレクション)



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BLU0001 Blue Pippin本体 (17インチモニター、キーボード、マウス付属) 1 ¥3,700,000
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